[发明专利]大黄鱼线粒体分子标记及用于养殖群体与野生种群的鉴别

摘要

大黄鱼线粒体分子标记及用于养殖群体与野生种群的鉴别。鉴别大黄鱼养殖群体与野生种群的线粒体分子标记为4个碱基的差异。鉴别步骤为设计合成一对保守引物L14841：5′－CCATCCAACATCTCAGCATGATGAAA－3′；H15149：5′－GCCCCTCAGAATGATATTTGT CCTCA－3′；对养殖与野生种群的线粒体DNA中细胞色素B(cyt b)基因进行PCR扩增；扩增结果经纯化；测序，对比测序结果。由4个群体大黄鱼mtDNA Cytb基因324bp序列排序结果可以看出大黄鱼养殖群体与野生群体存在4个碱基的差异，表现为1个颠换，3个转换。其结果稳定，可重复性强。3个野生群体的扩增结果一致。4个碱基的差异可作为区分养殖与野生群体的分子标记。鉴别方法简单。

主权项

1、鉴别大黄鱼养殖群体与野生种群的线粒体分子标记为NDHY CTACTCGCCCTCTGTCTAGGCGCCCAAATCCTCACAGGACTCTTCCTCGCTATACACTAC 60DDHY ************************************************************ 60MDHY ************************************************************ 60YDHY ********************************************************T*** 60ruler 1.......10........20........30........40........50........60NDHY ACATCCGACGTCACCATGGCCTTTTCATCTGTCGCACACATCTGCCGTGACGTAAACTAC 120DDHY ************************************************************ 120MDHY ************************************************************ 120YDHY *****G****************************************************** 120ruler ........70........80........90.......100.......110.......120NDHY GGGTGACTCATCCGAAATCTCCACGCTAATGGTGCCTCTTTCTTTTTCATCTGCCTCTAC 180DDHY ************************************************************ 180MDHY ************************************************************ 180YDHY ************************************************************ 180ruler .......130.......140.......150.......160.......170.......180NDHY CTCCATATTGGCCGAGGCCTCTACTATGGCTCCTATCTTTACAAAGAGACATGAAACATC 240DDHY ************************************************************ 240MDHY ************************************************************ 240YDHY ******************************************C***************** 240ruler.......190.......200.......210.......220.......230.......240NDHY GGAGTCGTACTCTTTCTCCTTGTAATAATGACCGCTTTTGTTGGCTATGTGTTACCTTGA 300DDHY ************************************************************ 300MDHY ************************************************************ 300YDHY **************************************************A********* 300ruler.......250.......260.......270.......280.......290.......300NDHY GGACAAATATCATTCTGAGGGGCA 324DDHY ************************ 324MDHY ************************ 324YDHY ************************ 324 ruler.......310.......320....其中“*”表示相同的碱基序列位点，NDHY：海南沿海硇洲族野生大黄鱼；DDHY：浙江、江苏沿海岱衢族野生大黄鱼；MDHY：福建、广东东部沿海闽粤东族野生大黄鱼；YDHY：闽粤东族养殖大黄鱼。