[发明专利]分泌性蛋白质家族

摘要

本发明涉及一族新颖的分泌性蛋白质，称作SECFAM1家族，它的家族成员包括新颖蛋白质INSP113、INSP114、INSP115、INSP116和INSP117，经本发明鉴定为分泌性蛋白质，含有带表皮生长因子(EGF)折叠的长125－153个氨基酸的结构域，以及含有8个保守性半胱氨酸残基；本发明还涉及这些蛋白质和编码基因的核酸序列在诊断、预防和治疗疾病中的用途。

主权项

1.一种鉴定SECFAM1家族成员的方法，其特征在于，所述方法包括：搜索翻译核酸序列或多肽序列数据库，鉴定一个与下列序列轮廓相匹配的多肽序列： A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V1M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 02N 1 2 2 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 3 -2 -2 1 0 -3 -2 -13K 0 0 -1 0 -2 1 2 -2 -1 0 -1 1 -1 -3 2 -1 -1 -3 -2 14R 0 3 -1 -2 4 0 -1 -2 -1 0 0 0 0 -2 -2 1 -1 -3 -2 -15Y 1 0 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 0 0 -1 0 -1 3 0 -1 -2 2 06L -1 2 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 0 3 2 -2 -2 0 1 -2 -2 -17Q 1 0 0 -1 -1 1 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 2 2 3 -1 -18K -1 -1 2 -1 -2 -1 -1 0 -1 0 0 1 2 -1 -2 0 0 -3 -2 29A 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -2 0 0 -1 0 -1 -2 0 -1 7 0 010T 0 1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 0 0 0 -2 1 2 1 -3 -2 -111Q 1 0 0 -1 -1 2 0 -1 -1 -1 0 0 0 -2 0 2 0 -3 -2 -112G 0 0 0 2 -2 -1 0 3 4 -2 -2 -1 2 -2 -2 0 -1 -2 -1 -213K 1 -1 -1 -1 -2 -1 -1 2 -2 -3 -2 0 -1 -1 -2 2 -1 7 -1 -214L 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 1 -2 -1 0 -2 0 0 -2 -1 1 8 0 -115L 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 3 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 216I -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 1 1 -3 -2 -1 -2 0 117I 1 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -2 -1 1 1 -2 0 0 3 -1 -1 -1 2 0181 0 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -2 -2 1 3 -1 0 -1 -2 1 0 -2 -1 019F -1 -2 -3 -3 6 -2 -3 -3 -1 -1 0 -2 3 2 -3 -2 -1 6 3 -120I 0 -2 -1 -2 -1 -2 -2 -2 -2 3 1 -2 0 -1 -2 1 1 -3 -1 221V 2 -2 -1 -2 3 -1 -1 -1 -2 0 0 -1 0 -2 -2 2 0 -3 -2 022T 1 -2 -2 -2 3 -1 -2 -2 -2 -1 0 -2 2 -1 -2 0 2 6 -1 023L -1 -3 -3 -3 4 -3 -3 -3 -2 0 2 -3 0 4 -3 -2 -1 -1 0 124W 0 -3 -3 -3 5 -2 -3 -2 -2 -1 0 -3 -1 0 -3 -1 -1 9 0 -125G 1 -2 -1 -2 4 -1 -2 1 -2 0 0 -1 2 -2 -2 0 1 -2 -2 026K -1 0 -1 -2 1 1 0 -3 1 0 1 2 0 2 -2 -1 -1 -2 0 -127A 0 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 3 -2 3 0 0 -2 -1 -2 -1 128V 0 -2 -2 -3 4 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 3 -1 -2 -1 0 -2 -1 229S 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 5 -1 1 -1 0 -1 -2 2 0 -3 0 -130S 4 -1 -1 -2 -1 -1 -1 2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 1 1 -3 -2 -131A 1 -1 0 0 -1 1 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -232N -1 -1 2 -1 -2 -1 -2 -2 -1 0 3 -1 0 1 -3 1 -1 -2 -1 033H -1 0 0 -1 -2 5 0 -3 3 -1 1 0 0 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -134H -1 0 0 -1 -2 0 0 -2 6 0 -1 0 -1 -2 2 0 -1 -3 0 -135K -1 0 0 -1 -3 3 0 -2 4 -3 -2 1 -1 -3 3 0 -1 -2 0 -236A 2 1 0 -1 -1 0 -1 -1 4 -1 -1 0 -1 -2 -1 0 2 -2 0 -137H 0 -1 0 -1 -2 -1 -1 3 6 -3 -3 -1 -2 -2 -2 1 -1 -2 0 -238H 0 -1 0 -2 5 -1 -1 -2 5 -1 0 -1 -1 -1 -2 0 1 -2 0 -139V -1 -2 -2 -2 -2 -1 0 -3 -2 2 2 -2 0 -1 2 -2 -1 -3 -1 240R 1 2 -1 -1 -2 1 1 -1 -1 -2 -2 3 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -241T 2 -1 -1 -1 -2 3 0 1 -1 -2 -2 0 -1 -3 0 0 2 -2 -2 -142G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -343T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 044C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -145E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -246V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 447V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 448A 4 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 2 -3 -2 049L 3 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 0 2 -2 0 -1 -2 0 0 -3 -1 150H -2 -1 0 3 -3 0 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -1 -2 -3 0 -351R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -352C -1 -3 -1 3 8 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -253C 0 -2 -1 -2 8 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -2 -2 2 0 -2 -2 -154N -1 0 6 0 -2 0 0 0 0 -3 -3 0 -2 -3 -2 2 0 -4 -2 -355K -1 2 0 -1 -3 3 0 -2 -1 -3 -2 4 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -256N -2 -1 6 0 -3 0 0 -1 0 -3 -3 0 -2 -3 3 0 0 -4 -2 -357K -1 5 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 3 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -358I -1 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -2 4 0 -1 0 -1 -3 -2 -1 -3 -1 159E -1 0 0 0 -3 0 5 -2 -1 -2 -2 0 -2 -3 -1 0 2 -3 -2 -160E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -3 -1 2 -1 0 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 061R 1 5 -1 -2 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -3 -2 0 -1 -3 -2 -262S 0 2 0 -1 -2 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -263Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 0 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -264T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 065V 2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 1 0 -2 0 -1 -2 -1 0 -3 -1 466K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -267C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -168S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -169C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -170F -2 2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 -1 0 1 -1 0 4 -3 -2 -2 -1 0 -171P -1 0 -1 -1 -3 0 0 -2 -2 -3 -3 2 -2 -3 5 1 -1 -4 -3 -272G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -373Q -1 0 0 0 -3 6 1 -2 0 -3 -2 2 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -274V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 475A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 076G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -377T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 078T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 079R -1 6 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 1 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -380A 4 -1 1 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 081A 0 4 0 -2 -2 2 0 -2 -1 -2 0 2 0 -3 -2 0 -1 -3 -2 -282P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -283S 2 -1 0 -1 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -184C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -185V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 586D -2 -2 0 6 -3 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -387A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 088S 0 2 0 -1 -1 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 0 -3 -2 -289I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 5 1 -3 0 0 -3 -2 -1 -3 -1 290V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 491E -1 1 -1 -1 -2 0 1 -3 -2 2 1 2 0 -1 -2 -1 -1 -3 -2 092Q -1 0 0 0 -2 4 1 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 0 2 2 -1 -293K -1 2 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -294W -2 -1 -2 -2 -2 2 -1 -2 -1 -3 -2 -1 -1 0 -3 -2 -2 10 0 -395W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -396C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -197H -2 0 1 3 -3 2 2 -2 5 -3 -3 0 -2 -2 -1 0 -1 -3 0 -398M -1 -1- 2 -3 -1 0 -2 -3 -2 0 1 -1 7 0 -2 -1 -1 -1 -1 099Q -1 0 2 0 -3 2 3 -2 0 -1 1 0 0 -2 -2 0 -1 -3 -2 -1100P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2101C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1102L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 1103E -1 -1 -1 0 -3 0 5 -2 -1 -1 0 0 -1 -2 0 0 -1 -3 -2 0104G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3105E -1 0 0 1 -4 1 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2106E -1 -1 0 2 -4 0 4 2 -1 -3 -4 0 -3 -3 -1 0 -1 -3 -3 -3107C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1108K -1 1 0 3 -3 0 0 -2 -1 -3 -3 4 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2109V 0 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -3 -3 1 2 -2 0 -1 -2 -1 1 -3 -1 4110L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 1 4 -2 1 0 -3 -2 -1 -2 -1 0111P -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 2 -1 -2 -1 -2 6 -1 -1 -4 -2 0112D -2 -1 3 6 -3 0 1 -1 0 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3113R -1 3 2 -2 -2 0 -1 -2 0 -1 1 0 0 -1 -2 0 -1 -2 1 -1114K 0 -1 0 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 1 -1 -2 -1 4 1 -3 -2 -2115G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3116W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 0 -4 -3 -2 11 1 -3117S 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 2 -2 -1 3 3 -2 -2 -1118C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1119S 1 -1 0 -1 -1 -1 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -2 0120S 0 0 0 0 -2 3 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 3 1 -3 -2 -2121G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3122N -1 -1 5 0 -3 -1 -1 3 4 -3 -3 -1 -2 -3 -2 0 -1 -3 -1 -3123K -1 3 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2124V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -4 -3 4 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 4125K -1 1 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2126T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0127T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 6 -2 -2 0128R -1 3 0 -1 -2 0 0 -2 -1 -2 -2 4 -1 -3 -1 0 2 -3 -2 -2129V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -1 -2 -2 0 -3 -1 5130T 0 -1 0 -1 -1 0 -1 -1 2 -1 0 -1 -1 -2 -1 3 3 -3 -1 -1131H -1 4 0 -1 -3 0 0 -2 4 -3 -2 0 -1 -3 3 -1 -1 -3 -1 -3其中，当把所述序列轮廓作为查询序列输入到搜索程序BLAST时，采用生物信息国家中心(NCBI)确定的缺省参数[Blosum 62矩阵；空位开放罚分＝11，空位拓展罚分＝1]，E值为10-2或以下的那些就是SECFAM1家族成员。