[发明专利]建立和分析氨基酸序列构象的方法无效

专利信息
申请号: 200480025709.1 申请日: 2004-09-08
公开(公告)号: CN1849611A 公开(公告)日: 2006-10-18
发明(设计)人: 杰拉尔德·伯姆;罗马·达鲁格 申请(专利权)人: ACGT前基因组公司
主分类号: G06F19/00 分类号: G06F19/00
代理公司: 北京德琦知识产权代理有限公司 代理人: 王琦;宋志强
地址: 德国*** 国省代码: 德国;DE
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摘要: 发明涉及建立和分析氨基酸序列构象的方法。特别涉及确认给定的基于氨基酸的分子构象的方法,从线性氨基酸序列开始的构象确定的方法,以及对比两个或更多个氨基酸序列的方法。
搜索关键词: 建立 分析 氨基酸 序列 构象 方法
【主权项】:
1、一种用于确认给定的基于氨基酸的分子构象的方法,该方法包括如下步骤:a)将该基于氨基酸的分子分成相同长度的低聚肽,其中该低聚肽的数量优选由下式定义: n-(m-1)其中n是在该基于氨基酸的分子中氨基酸的数量,m是在该低聚肽中氨基酸的数量,并确定这些低聚肽的Ψ和Φ角(观测值);b)提供或准备低聚肽数据库,该数据库包含这些低聚肽的Ψ和Φ角的值;c)从该数据库信息中为步骤a)中确定的每个低聚肽确定Ψ和Φ角(预期值);d)从观测值中减去预期值;e)评价每个氨基酸位置的差异,其中预期值和观测值之间的差异越小,所述给定结构精确的概率越高。
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