[发明专利]建立和分析氨基酸序列构象的方法无效
申请号: | 200480025709.1 | 申请日: | 2004-09-08 |
公开(公告)号: | CN1849611A | 公开(公告)日: | 2006-10-18 |
发明(设计)人: | 杰拉尔德·伯姆;罗马·达鲁格 | 申请(专利权)人: | ACGT前基因组公司 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 北京德琦知识产权代理有限公司 | 代理人: | 王琦;宋志强 |
地址: | 德国*** | 国省代码: | 德国;DE |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 本发明涉及建立和分析氨基酸序列构象的方法。特别涉及确认给定的基于氨基酸的分子构象的方法,从线性氨基酸序列开始的构象确定的方法,以及对比两个或更多个氨基酸序列的方法。 | ||
搜索关键词: | 建立 分析 氨基酸 序列 构象 方法 | ||
【主权项】:
1、一种用于确认给定的基于氨基酸的分子构象的方法,该方法包括如下步骤:a)将该基于氨基酸的分子分成相同长度的低聚肽,其中该低聚肽的数量优选由下式定义: n-(m-1)其中n是在该基于氨基酸的分子中氨基酸的数量,m是在该低聚肽中氨基酸的数量,并确定这些低聚肽的Ψ和Φ角(观测值);b)提供或准备低聚肽数据库,该数据库包含这些低聚肽的Ψ和Φ角的值;c)从该数据库信息中为步骤a)中确定的每个低聚肽确定Ψ和Φ角(预期值);d)从观测值中减去预期值;e)评价每个氨基酸位置的差异,其中预期值和观测值之间的差异越小,所述给定结构精确的概率越高。
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