[发明专利]一种鉴定可用作药物靶点的蛋白质编码DNA序列的基于计算机的通用方法有效
| 申请号： | 200480040837.3 | 申请日： | 2004-01-09 |
| 公开（公告）号： | CN1914616A | 公开（公告）日： | 2007-02-14 |
| 发明（设计）人： | S·K·布拉马查里;D·达舍;R·沙尔马;J·K·马赫施瓦瑞 | 申请（专利权）人： | 科学工业研究委员会 |
| 主分类号： | G06F19/00 | 分类号： | G06F19/00 |
| 代理公司： | 上海专利商标事务所有限公司 | 代理人： | 范征 |
| 地址： | 印度*** | 国省代码： | 印度;IN |
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| 摘要： | 本发明涉及一种利用特别开发的软件GeneDecipher鉴定基因组中可用作药物靶点的蛋白质编码DNA序列(基因)的通用方法，所述方法包括用计算机处理字母顺序排列的长度为‘N’的肽从已知基因组产生肽文库；人工翻译该测试基因组获得对应于每个读框的多肽；根据与肽文库的重叠情况将每条多肽序列转变为字母数字式序列，其中每条序列对应于一个读框；用S形(曲线)学习函数将人工神经网络(ANN)训练为字母数字式序列；解密该测试基因组中的蛋白质编码区；从而鉴定对大量已知基因作图的肽的较长延伸段和它们对应的蛋白质；最后本发明涉及防治病原生物导致疾病的方法，包括通过抑制一种或多种本发明步骤鉴定到的蛋白质功能来评价提出的候选药物。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 鉴定 用作 药物 蛋白质 编码 dna 序列 基于 计算机 通用 方法 | ||
【主权项】：
1.一种鉴定用作药物靶点的蛋白质编码DNA序列的基于计算机的通用方法，所述方法包括以下步骤；a.用计算机处理以字母顺序排列的长度为‘N’的肽从已知基因组产生肽文库；b.人工翻译该测试基因组获得每个读框的多肽；c.根据这些寡肽在肽文库的出现情况将每条多肽序列转变为字母数字式序列，其中每条序列对应于一个读框；d.用S形(曲线)学习函数将人工神经网络(ANN)训练成对应于已知的蛋白质编码DNA序列和已知的非编码区的字母数字式序列；e.解密该测试基因组中的蛋白质编码区；和f.鉴定对大量用作功能标记物的已知基因作图的肽的较长延伸段。
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