[发明专利]假单胞菌Na+/H+逆向转运蛋白基因及其克隆方法无效

专利信息
申请号: 200510006572.1 申请日: 2005-02-23
公开(公告)号: CN1667122A 公开(公告)日: 2005-09-14
发明(设计)人: 刘广发;陈启伟 申请(专利权)人: 厦门大学
主分类号: C12N15/31 分类号: C12N15/31;C12N15/10;C12Q1/68
代理公司: 厦门南强之路专利事务所 代理人: 马应森
地址: 361005福*** 国省代码: 福建;35
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摘要: 假单胞菌Na+/H+逆向转运蛋白基因及其克隆方法,涉及一种基因克隆。提供一种假单胞菌的Na+/H+逆向转运蛋白结构基因及一种既快捷又经济的克隆方法,基因长1089bp,编码362个氨基酸。步骤为将极端耐盐假单胞菌接种,培养;提取总DNA;设计引物;PCR反应并将扩增产物凝胶成像系统扫描记录,切下扩增的约1.1kb的条带;在PCR产物末端加上一个腺嘌呤脱氧核糖核苷酸(A),弃上清液,加入20μL重蒸水溶解DNA;载体与DNA的连接,形成单菌落;挑选白色菌落,碱裂解法提取重组质粒;鉴定所扩增的目的基因;检测转化子的耐盐水平;转化子中的重组质粒经鉴定,对其中的克隆基因进行测序;判断克隆基因。
搜索关键词: 假单胞菌 na sup 逆向 转运 蛋白 基因 及其 克隆 方法
【主权项】:
1、假单胞菌Na+/H+逆向转运蛋白基因,其特征在于其序列如下:1 ATGATTATGGCCAACAGCGGCGCAACCAGTGGATGGTATCACGACTTTCTGGAGACGCCG 6061 TTCACTCGGTTGGTTCACTCGAAATCAAGCAAAAACATGCTGTTATGGATAAATGACGCG 120121 CTGATGGCGGTATTTTTCCTGTTAGTCGGTCTGGAAGTTAAACGTGAACTGATGCAAGGA 180181 TCGCTAGCCAGCTTACGCCAGGCCGCATTTCCAGTTATCGCCGCTATTGGTGGGATGATT 240241 GTGCCGGCATTACTCTATCTGGCTATTAACTATGCCGATCCGATTACCCGCCAAGGGTGG 300301 GCGATCCCGGCGGCTACTGACATTGCTTTTGCACTTGGTGTACTGGCGCTGTTGGGAAGT 360361 CGTGTTCCGTTTGCGCTGAAGATCTTTATGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGG 420421 GCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCCTC 480481 GCGGCTGTAGCATTTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGCACGCCGCACGGGC 540541 GTCTATATTCTTGTTGGCGTGGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCA 600601 ACTCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCCTTCT 660661 CCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTGCACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTG 720721 TTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCC 780781 ATTCTGCCATTGGGGATCATCGCTGGCTTGCTGATTGGCAAACCGCTGGGGATTAGTCTG 840841 TTCTGCTGGTTGGCGCTGCGTTTGAAACTGGCGCATCTGCCTGAGGGAACGACTTATCAG 900901 CAAATTATGGTGGTGGGGATCGTGTGCGGTATCGGTTTTACTATGTCTATCTTTATTGCC 960961 AGCCTGGCCTTTGGTAGCGTAGATCCAGAACTGATTAACTGGGCGAAACTCGGTATCCTG 10201021 GTCGGTTCTATCTCTTCGGCGGTAATTGGATACAGCTGGTTACGCGTTCGTTTGCGTCCA 10801081 TCAGTTTGA 1089本基因基因长1089bp,编码362个氨基酸。根据原核基因的特征分析,序列的前3个核苷酸“ATG”(黑体字)为基因的起始密码子;接着,根据三联体密码,推算出该基因的编码氨基酸序列;最后的3个核苷酸“TGA”(黑体字)为基因的终止符;通过BLAST软件分析,该基因推测的编码氨基酸序列如下:MIMANSGATSGWYHDFLETPFTRLVHSKSSKNMLLWINDALMAVFFLLVGLEVKRELMQGSLASLRQAAFPVIAAIGGMIVPALLYLAINYADPITRQGWAIPAATDIAFALGVLALLGSRVPFALKIFMMALAIIDDLGAIIIIALFYTNDLSMASLGLAAVAFAVLAVLNLCGARRTGVYILVGVVLWTAVLKSGVHATLAGVIVGFFIPLKEKHGPSPAKRLEHVLHPWVAYLILPLFAFANAGVSLQGVTLDGLTSILPLGIIAGLLIGKPLGISLFCWLALRLKLAHLPEGTTYQQIMVVGIVCGIGFTMSIFIASLAFGSVDPELINWAKLGILVGSISSAVIGYSWLRVRLRPSV
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