[发明专利]病原微生物模拟表位的生物信息学筛选方法无效
| 申请号： | 200510018067.9 | 申请日： | 2005-09-30 |
| 公开（公告）号： | CN1772921A | 公开（公告）日： | 2006-05-17 |
| 发明（设计）人： | 吴谡琦;孙修勤;张进兴;郑凤荣;洪旭光;曲凌云 | 申请（专利权）人： | 国家海洋局第一海洋研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 青岛海昊知识产权事务所有限公司 | 代理人： | 张中南 |
| 地址： | 266061*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 一种病原微生物模拟表位的生物信息学筛选方法。本方法首先对LCDV－1基因组序列进行了BLAST比对，从中筛选得到保护性抗原蛋白候选基因TK和ORF29；然后分别对两个基因表达的蛋白质进行了疏水和亲水性、抗原性和跨膜结构分析，综合12种结构性质分析结果，最后通过综合性抗原指数的计算公式(I)，其中，将I＞O的序列推定未知的LCDV－cn相应的模拟表位。再将上述获得的模拟表位进行人工合成，通过竞争性酶联免疫吸附分析检验各种模拟表位的免疫反应性。本发明充分利用丰富的核酸和蛋白质序列资源，通过特定的生物信息学分析方法快速捕获未知病源微生物抗原蛋白的模拟表位。 | ||
| 搜索关键词： | 病原微生物 模拟 生物 信息学 筛选 方法 | ||
【主权项】：
1、病原微生物模拟表位的生物信息学筛选方法，首先对LCDV-1基因组序列进行了BLAST比对，从中筛选得到两个保护性抗原蛋白候选基因TK和ORF29；然后分别对两个基因表达的蛋白质进行了疏水和亲水性、抗原性和跨膜结构分析，综合12种结构性质分析结果，最后通过综合性抗原指数的计算公式(I)，其中，将I＞O的序列推定为未知的LCDV-cn模拟表位。
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