[发明专利]基于主集分割的基因芯片表达谱数据聚类方法无效
申请号: | 200510027604.6 | 申请日: | 2005-07-07 |
公开(公告)号: | CN1710558A | 公开(公告)日: | 2005-12-21 |
发明(设计)人: | 沈一帆 | 申请(专利权)人: | 复旦大学 |
主分类号: | G06F17/30 | 分类号: | G06F17/30 |
代理公司: | 上海正旦专利代理有限公司 | 代理人: | 陆飞;盛志范 |
地址: | 20043*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明属于数据挖掘技术领域,具体涉及一种基于主集分割的基因芯片表达谱数据聚类方法。其步骤是,先利用主集方法对原始数据进行重排序,使高度相似的基因排列在同一特定区域,由此定位一个类;将找到的类从当前数据集中排除,对剩下的数据重复以上处理,直至满足所提出的停止的条件为止。本方法算法简单,易于实现;数据输入顺序不敏感,且抗噪能力强。结果中的类质量好,不相似的元素不会划分在一个类中,而且根据需要具有延展性。 | ||
搜索关键词: | 基于 分割 基因芯片 表达 数据 方法 | ||
【主权项】:
1、一种基于主集分割的基因芯片表达谱数据聚类方法,其特征在于具体步骤如下;首先,利用主集方法对基因或样本进行重新排序,使表达谱高度相似的基因排列在同一特定区域,由此确定一个类;其中,类的分割的定位标准是,根据类内元素间平均相信性高于类外元素间的平均相似性的性质,从排序后的基因或样本序列中划出具有高相似表达的基因或样本的类;然后,将找到的类从当前数据集中排除,对剩下的数据重复以上过程,直至满足所提出的循环条件为上。
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