[发明专利]用于识别有治疗潜力的粘附素和粘附素样蛋白的计算方法无效
申请号: | 200580010511.0 | 申请日: | 2005-02-07 |
公开(公告)号: | CN101019123A | 公开(公告)日: | 2007-08-15 |
发明(设计)人: | G·沈迪华;K·库玛;P·杰恩;S·K·布拉玛查理;斯里尼瓦桑·拉马钱德兰 | 申请(专利权)人: | 科学与工业研究委员会 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00;G01N33/68 |
代理公司: | 北京北翔知识产权代理有限公司 | 代理人: | 李雒英;郑建晖 |
地址: | 印度*** | 国省代码: | 印度;IN |
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摘要: | 用于识别粘附素和粘附素样蛋白的计算方法,该方法包括:计算神经网络软件基于序列的性质,其中所述性质为(i)氨基酸频率,(ii)多重态频率,(iii)二肽频率,(iv)电荷组成和(v)疏水组成;为上述计算后的五个性质中的每一个性质训练人工神经网络(ANN);和识别粘附素和粘附素样蛋白,所述粘附素样蛋白是粘附素的概率(Pad)为≥0.51。一种用于执行该方法的计算机系统。编码粘附素和粘附素样蛋白的基因和蛋白质。 | ||
搜索关键词: | 用于 识别 治疗 潜力 粘附 蛋白 计算方法 | ||
【主权项】:
1.用于识别粘附素和粘附素样蛋白的计算方法,包括如下步骤:a)使用SPAAN软件的五个性质模块来计算蛋白序列的基于序列的性质,其中所述性质是:(i)氨基酸频率,(ii)多重态频率,(iii)二肽频率,(iv)电荷组成和(v)疏水组成;b)为每一个经计算的性质训练人工神经网络(ANN);和c)识别粘附素和粘附素样蛋白,所述粘附素样蛋白确是粘附素(Pad)的概率≥0.51。
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