[发明专利]用于在有丝真菌细胞中生产感兴趣化合物的方法

摘要

本发明涉及下述核苷酸序列，所述序列包含：具有经优化的密码子频率的同义核苷酸编码序列，优化使得天然密码子被同义密码子交换，所述同义密码子编码与天然密码子相同的氨基酸，并且具有较之天然密码子更高的密码子使用频率(表1中定义的)；可选地，所述核苷酸序列包含控制序列，例如：定向于从5’到3’方向的一种翻译终止序列，其选自下述序列：TAAG、TAGA和TAAA，优选地，TAAA，和/或定向于从5’到3’方向的一种翻译起始编码序列，其选自下述序列：gctnccyyc，使用下述不确定的核苷酸代码：v(A/C/G)；n(A/C/G/T)，优选地，5’－GCT TCCTTC－3’。本发明还涉及共享的翻译起始序列：5’－mwChkyCAmv－3’，优选地，翻译起始序列选自5’－mwChkyCAAA－3’、5’－mwChkyCACA－3’和5’－mwChkyCAAG－3’构成的组。

主权项

1.一种核苷酸序列，其包含：-同义核苷酸编码序列，其具有经优化的密码子频率，使得天然密码子被同义密码子替换，所述同义密码子编码与所述天然密码子相同的氨基酸，并且较之所述天然密码子具有更高的、如表1中定义的密码子使用频率；以及可选地，所述核苷酸序列包含控制序列，例如：-一种翻译终止序列，其定向于从5’到3’方向，其选自下述序列：TAAG、TAGA和TAAA，优选地，TAAA，和/或-一种翻译起始子编码序列，其定向于从5’到3’方向，其选自下述序列：GCTACCCCC、GCTACCTCC、GCTACCCTC、GCTACCTTC、GCTCCCCCC、GCTCCCTCC、GCTCCCCTC、GCTCCCTTC、GCTGCCCCC、GCTGCCTCC、GCTGCCCTC、GCTGCCTTC、GCTTCCCCC、GCTTCCTCC、GCTTCCCTC和GCTTCCTTC，优选地，是GCT TCC TTC。表1：关于同义密码子的优化的有丝真菌密码子频率，以％表示 .T. .C. .A. .G. T.. Phe 0 Ser 21 Tyr 0 Cys 0 ..T T.. Phe 100 Ser 44 Tyr 100 Cys 100 ..C T.. Leu 0 Ser 0 终止 100 终止 0 ..A T.. Leu 13 Ser 14 终止 0 Trp 100 ..G C.. Leu 17 Pro 36 His 0 Arg 49 ..T C.. Leu 38 Pro 64 His 100 Arg 51 ..C C.. Leu 0 Pro 0 Gln 0 Arg 0 ..A C.. Leu 32 Pro 0 Gln 100 Arg 0 ..G A.. Ile 27 Thr 30 Asn 0 Ser 0 ..T A.. Ile 73 Thr 70 Asn 100 Ser 21 ..C A.. Ile 0 Thr 0 Lys 0 Arg 0 ..A A.. Met 100 Thr 0 Lys 100 Arg 0 ..G G.. Val 27 Ala 38 Asp 36 Gly 49 ..T G.. Val 54 Ala 51 Asp 64 Gly 35 ..C G.. Val 0 Ala 0 Glu 26 Gly 16 ..A G.. Val 19 Ala 11 Glu 74 Gly 0 ..G