[发明专利]用于检测和/或定量细胞在响应外在刺激时的等级分子变化的方法和工具

摘要

本发明涉及一种检测和/或定量响应于任何外在刺激细胞的等级(受调节的)分子变化的方法。

主权项

1.通过整合至少第一水平的细胞功能和第二水平的细胞功能来表征细胞响应外在生物学、物理和/或化学刺激的等级分子变化的方法，其中参与第一水平的分子是与第二水平的分子的表达相互作用的调节分子，所述方法通过如下步骤实施：a)从所述细胞获得细胞提取物；b)通过在微阵列上对细胞提取物实施第一试验，检测和/或定量第一水平细胞功能的分子细胞变化，所述第一试验能够实现：-检测和/或定量细胞提取物中存在的至少5种不同的活化的转录因子；和/或-检测和/或定量至少5种不同的激酶的活性；c)通过在微阵列上对相同的细胞提取物实施第二试验，检测和/或定量第二水平细胞功能的分子细胞变化，所述第二试验包括：-检测和/或定量至少10种不同的表达基因和/或，-检测和/或定量至少10种不同的由这些表达基因所编码的相应蛋白质，其中所述的表达的基团与相应的合成的蛋白质受到所述第一水平细胞功能的活化的转录因子和激酶的调节，d)收集检测和/或定量所述的表达的基团和/或合成的蛋白质的结果以及检测和/或定量所述活化的转录因子和/或活化的激酶的结果；e)将所述检测和/或定量所述的表达的基团和/或合成的蛋白质的结果与所述检测和/或定量所述活化的转录因子和/或活化的激酶的结果关联起来；f)将所述检测和/或定量的结果及它们的相关性通过计算机整合入等级系统模型中，g)表征由所述外在生物学、物理和/或化学刺激导致的在细胞中的等级分子变化，其提供了在第一水平和/或第二水平检测和/或定量到的细胞分子变化之间的功能联系。