[发明专利]一种基于独立分量集成学习的基因微阵列数据预测方法无效
申请号: | 200710132391.2 | 申请日: | 2007-09-15 |
公开(公告)号: | CN101145171A | 公开(公告)日: | 2008-03-19 |
发明(设计)人: | 黄德双;刘昆宏 | 申请(专利权)人: | 中国科学院合肥物质科学研究院 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00;G06F17/30 |
代理公司: | 安徽省合肥新安专利代理有限责任公司 | 代理人: | 赵晓薇 |
地址: | 230031安徽省合*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | 本发明涉及一种基于独立分量集成学习的基因微阵列数据预测方法,该方法依据独立分量集成判别系统的微阵列数据判别,其步骤包括:对微阵列数据进行独立分量分析变化;基于随机分量选择的独立分量分类器构建;分类器集成系统的构造。首先对微阵列数据进行独立分量变换,在获得的独立分量集合中,随机选择一个子集构造分类器。重复构造50个分类器,在此基础上,由加权投票法将这些基分类器组合构成一个分类器集成系统。本发明保证了使用的独立分量分类器集成系统比单个分类器有较高的精确度和稳健性;无需考虑具体参数选择的问题,提高了系统的易用性;集成分类器训练时间、存储容量要求不高。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 独立 分量 集成 学习 基因 阵列 数据 预测 方法 | ||
【主权项】:
1.一种基于独立分量集成学习的基因微阵列数据预测方法,其特征在于该方法的操作步骤如下:数据的获取与预处理,对试验的训练样本进行独立分量分析(IndependentComponent Analysis,简写为ICA)变化,获得一组独立分量(IndependentComponent,简写为IC)集合;独立分量子集的生成,从IC分量集合中随机有重复地选择出一半的IC分量,用于构建一个IC分量子集,重复以上步骤50次,形成50个独立的IC分量子集;基分类器的生成,使用生成的IC分量子集分别用于训练最近邻分类器,从而构造50个基于随机独立分量选择的最近邻分类器;将新样本在各个新的IC分量子集所代表的分量空间中进行变换,而后分别使用50个最近邻分量器对新样本进行测试,测试的输出使用加权投票法进行综合,从而构建出一个分类器集成系统。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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