[发明专利]膜蛋白分类在线预报方法无效
申请号: | 200710171805.2 | 申请日: | 2007-12-06 |
公开(公告)号: | CN101187960A | 公开(公告)日: | 2008-05-28 |
发明(设计)人: | 金雨欢;陆文聪;钮冰;刘亮;王丽 | 申请(专利权)人: | 上海大学 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00;G06F15/18 |
代理公司: | 上海上大专利事务所 | 代理人: | 何文欣 |
地址: | 200444*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了一种膜蛋白分类在线预报方法。本方法是利用机器学习方法Bagging对一个膜蛋白数据库样本进行学习,输出学习模型。预报器载入学习模型,输入数据转换器由Web客户端提交的膜蛋白序列码转换所得只包含“0”和“1”的数据,输出膜蛋白分类预测结果,通过Servlet组件返回到Web客户端。本发明能够基于普通的Web客户端单个或批量预测膜蛋白序列的膜蛋白类型。 | ||
搜索关键词: | 膜蛋白 分类 在线 预报 方法 | ||
【主权项】:
1.一种膜蛋白分类在线预报方法,其特征在于利用机器学习方法Bagging,对一个膜蛋白数据库样本进行学习,输出学习模型;由预报器载入该学习模型,输入数据传输器将Web客户端提交的膜蛋白序列码转换为只包含“0”和“1”的数据,输出模蛋白分类预测结果,通过Servlet组件返回到Web客户端。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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