[发明专利]多氧霉素生物合成基因簇及其应用无效

专利信息
申请号: 200710171893.6 申请日: 2007-12-06
公开(公告)号: CN101195828A 公开(公告)日: 2008-06-11
发明(设计)人: 邓子新;陈文青;周秀芬;由德林;贺新义;白林泉 申请(专利权)人: 上海交通大学
主分类号: C12N15/31 分类号: C12N15/31;C12N15/63;C12N1/15;C12N1/19;C12N1/21
代理公司: 上海交达专利事务所 代理人: 王锡麟;王桂忠
地址: 200240*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及的是一种基因工程技术领域多氧霉素生物合成基因簇及其应用。编码多氧霉素生物合成所涉及的20个基因,具体为:(1)负责多氧霉素生物合成的结构共13个基因;(2)负责多氧霉素生物合成的polR,polY共3个调节基因;(3)负责转运的基因polQ1,polQ2,即共2个基因;(4)功能未知基因,polE,polL共2个基因。利用多氧霉素生物合成基因簇用于多氧霉素的高产菌株或有效组分高产菌株的分子育种。本发明所提供的基因及其所编码的蛋白质,也可以用来查找和发展可用于医药,工业,农业的化合物或蛋白。
搜索关键词: 霉素 生物 合成 基因 及其 应用
【主权项】:
1.一种多氧霉素生物合成基因簇,其特征在于,编码多氧霉素生物合成所涉及的20个基因,具体为:(1)负责多氧霉素生物合成的结构基因polA,polB,polC,polD,polE,polF,polG,polH,polI,polJ,polK,polL,polM,polN,polO,polP,即共13个基因:polA位于基因簇的核苷酸序列第12838-14175碱基处,长度1338碱基对编尿苷-5’-单磷酸烯醇式丙酮酸转移酶,445个氨基酸;polB位于基因簇的核苷酸序列第11999-12772碱基处,长度774碱基对,编码胸苷酸合成酶,257个氨基酸;polC位于基因簇的核苷酸序列第29476-28862碱基处,长度615碱基对编码羟化酶,204个氨基酸;polD位于基因簇的核苷酸序列第28857-28210碱基处,长度648碱基对编码羟化酶,215个氨基酸;polG位于基因簇的核苷酸序列第26166-24874碱基处,长度1293碱基对编码羧化酶,430个氨基酸;polH位于基因簇的核苷酸序列第24881-23472碱基处,长度1410碱基对编码典型S-腺苷酰-L-甲硫氨酸蛋白,469个氨基酸;polI位于基因簇的核苷酸序列第23475-22333碱基处,长度1143碱基对编码氨基转移酶,380个氨基酸;polJ位于基因簇的核苷酸序列第22336-21515碱基处,长度822碱基对编码磷酸化酶,273个氨基酸;polK位于基因簇的核苷酸序列第21528-20887碱基处,长度642碱基对编码羟化酶,213个氨基酸;polM位于基因簇的核苷酸序列第20041-19274碱基处,长度732碱基对编码短链脱氢酶,243个氨基酸;polN位于基因簇的核苷酸序列第19281-18775碱基处,长度507碱基对编码氨基酸N-酰基转移酶,168个氨基酸;polO位于基因簇的核苷酸序列第18778-17057碱基处,长度1722碱基对编码氨甲酰转移酶,573个氨基酸;polP位于基因簇的核苷酸序列第17060-16218碱基处,长度843碱基对编码酰基谷氨酸激酶,280个氨基酸;(2)负责多氧霉素生物合成的调节基因,即polR,polY共3个基因:polR位于基因簇的核苷酸序列第32787-36122碱基处,长度3336碱基对编码调控蛋白,1111个氨基酸;polY位于基因簇的核苷酸序列第32569-29681碱基处,长度2889碱基对编码途径专一性调控蛋白,962个氨基酸;(3)负责转运的基因polQ1,polQ2,即共2个基因:polQ1位于基因簇的核苷酸序列第16052-14793碱基处,长度567碱基对编码膜蛋白;polQ2位于基因簇的核苷酸序列第14796-14230碱基处,长度1260碱基对编码腺苷酸激酶,419个氨基酸;(4)功能未知基因,polE,polL共2个基因:polE位于基因簇的核苷酸序列第28187-27075碱基处,长度1113碱基对编码胆固醇氧化酶,370个氨基酸;polF位于基因簇的核苷酸序列第27023-26196碱基处,长度828碱基对编码氧化还原酶,275个氨基酸:polL位于基因簇的核苷酸序列第20830-20099碱基处,长度732碱基对编码胆固醇氧化酶,243个氨基酸。
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