[发明专利]检测方法

摘要

本发明总体上涉及核酸分子阵列，所述核酸分子的表达谱表征了大肠内的细胞或细胞的群体的解剖学来源。更具体地，本发明涉及核酸分子的阵列，所述核酸分子的表达谱表征了大肠内的细胞或细胞的群体的近端或远端来源。本发明的表达谱的应用包括但不限于确定源自大肠的细胞或细胞的群体的解剖学来源。更进一步，由于正常细胞向肿瘤状态的进展通常以表型去分化为特征，本发明的方法还提供了一种鉴定细胞异常性的手段，其基于相对于当对象细胞位于它们在结肠内的解剖学位置时被认为所应该表达的表达谱而言表达错误表达谱。因此，本发明的这一方面提供了鉴定存在大肠结肠细胞的重要手段，这些细胞表明大肠内的异常性，例如疾病(如结直肠肿瘤)的发生或发生倾向性。

主权项

1. 用于确定源自个体的大肠的细胞或细胞群体的解剖学来源的方法，所述方法包括：访问训练数据，包括代表源自至少一个大肠的已知近端-远端来源的细胞或细胞群体中的基因表达的表达训练数据和代表所述细胞或细胞群体与所述近端-远端来源的关联的近端-远端来源训练数据；处理所述训练数据以产生代表所述基因表达水平的线性或非线性组合的分类数据，所述分类数据被用于基于代表取自大肠的另外的细胞或细胞亚群中所述基因的表达的进一步的表达数据而产生进一步的近端-远端来源数据，所述进一步的近端-远端来源数据表明所述另外的细胞或细胞亚群的近端-远端来源。