[发明专利]使用样品拆分和DNA标签进行稀有细胞分析

摘要

本发明提供在胎儿细胞与母体细胞群混合时检测样品中的胎儿细胞存在情况并测试胎儿异常如异倍性的系统、装置和方法。本发明包括用不同标记来标记所述混合样品中每个细胞中的基因组DNA的区域，其中每个标记对每个细胞都是特异性的，并定量混合样品中每个细胞的基因组DNA的标记区。更具体地说，本发明涉及定量混合样品中每个细胞的标记DNA多态性。

主权项

一种用于确定胎儿染色体拷贝数的基于计算机的系统，其是基于来自妊娠或怀疑有妊娠的人女性的血液中的胎儿和母体细胞或DNA的混合样品来确定胎儿染色体拷贝数，所述系统包括:处理器，用于执行计算机可执行逻辑；存储器，用于存储计算机可执行逻辑和数据；富集装置，用于富集所述混合的母体血液样品中的胎儿细胞或胎儿DNA，所述混合的母体血液样品获得自正在妊娠或怀疑有妊娠的人女性，并且所述富集增加了样品中胎儿细胞或胎儿DNA的浓度或者胎儿细胞或胎儿DNA对母体细胞或母体DNA的比率；拆分装置，用于将富集产物拆分到载体上至少100个离散位置从而将各个细胞定位在可用作所述载体上可寻址部位的离散的位点，使得每个离散可寻址位置包含0或1个胎儿细胞，其中每个离散可寻址位置被分配对每个离散部位特异性的独有标签序列；标记装置，用于通过扩增用独有标签序列标记在每一离散位置的一个或多个基因组DNA区，所述标记装置包括PCR引物，所述PCR引物包含对每个离散部位特异性的独有标签序列；用于纯化和合并所述标记的基因组DNA区的装置；分析装置，用于通过超深测序分析合并的基因组DNA区从而定量所述基因组DNA区，基于扩增的基因组DNA区的独有标签序列，通过鉴定非母体等位基因确定所述载体上离散可寻址位置哪些含有胎儿细胞或胎儿DNA；和基于所述带有独有标签序列标记的胎儿细胞或胎儿DNA的基因组DNA区的数量确定胎儿染色体拷贝数的装置。