[发明专利]T细胞表位数据库在审
申请号: | 200780038253.6 | 申请日: | 2007-10-11 |
公开(公告)号: | CN101573711A | 公开(公告)日: | 2009-11-04 |
发明(设计)人: | 弗兰克·卡尔;马太·保罗·贝克 | 申请(专利权)人: | 安迪拓普有限公司 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 北京安信方达知识产权代理有限公司 | 代理人: | 陶贻丰;郑 霞 |
地址: | 英国*** | 国省代码: | 英国;GB |
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摘要: | 本发明涉及用于快速询问蛋白序列的T细胞表位存在的T细胞表位数据库、特别是辅助性T细胞表位数据库。本发明包括T细胞表位(包括用测试肽通过先体外后体内T细胞测定特别鉴定的表位)的全部或部分数据库和数据结构,并且包括通过外推来自测试肽的数据而鉴定的T细胞表位。本发明还包括用来确定肽的T细胞表位活性以随后包括在数据库和数据结构中的高通量方法,所述方法包括其中为最大化T细胞表位活性检测的灵敏性而从T细胞测定中去除或抑制T细胞亚型(特别是调节T细胞)的方法。 | ||
搜索关键词: | 细胞 数据库 | ||
【主权项】:
1.一种方法,其通过搜索先前分析过T细胞表位活性的肽序列的数据库来确定测试肽序列是否包含T细胞表位。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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