[发明专利]一种识别显著差异表达基因集合的方法

摘要

本发明公开了一种识别显著差异表达基因集合的方法，它包括以下步骤：(1)设置和输入数据；(2)将基因归属至各个基因集合；(3)检查每一个基因集合中基因的个数是否大于设置中定义的个数，如果结果为否，则抛弃此基因集合；(4)计算每一个基因集合的表达变化指数；(5)将整张芯片上所有基因作为背景基因，计算背景基因集合的表达变化指数；(6)从背景基因中随机抽样，检验各基因集合E值的显著性；(7)根据设定的E值和p值的阈值，输出符合阈值要求的基因集合作为识别结果。本发明方法对大基因集合识别效果优良，保证了在较少检测次数的情况下有较高的准确率，大大提高了基因表达值在实际应用中的价值。

主权项

1、一种识别显著差异表达基因集合的方法，其特征在于，它包括以下步骤：(1)设置和输入芯片数据；(2)将基因表达谱芯片所含基因归属至各个基因集合；(3)判断每一个基因集合中基因的个数是否大于设置中定义的个数，如果判断结果为否，则抛弃此基因集合；否则，执行下一步；(4)计算每一个基因集合的表达变化指数，即E’值；(5)将整张芯片上所有基因作为背景基因，按照步骤4的方法计算背景基因集合的表达变化指数；对每一个基因集合去除背景，产生真实的基因集合表达变化指数E值；(6)检验各基因集合E值的显著性；(7)根据设定的E值和p值的阈值，判断是否符合阈值要求，如果判断结果为否，则抛弃；如果判断结果为是，则输出识别结果；其中，步骤(7)中所述p值为置信度。