[发明专利]基于模型的聚类法与贝叶斯网络法的基因芯片数据分析法无效
申请号: | 200810061139.1 | 申请日: | 2008-03-11 |
公开(公告)号: | CN101256641A | 公开(公告)日: | 2008-09-03 |
发明(设计)人: | 陈铭;宁开达;陈晓辉;曹俊杰;罗聪 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | G06N7/00 | 分类号: | G06N7/00;G06F19/00 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 | 代理人: | 张法高 |
地址: | 310027*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开了一种结合基于模型的聚类法与贝叶斯网络法的基因芯片数据分析方法。包括如下步骤:1)利用基于模型的聚类方法,根据基因在不同芯片实验中的表达情况将差异表达的基因进行聚类;2)将聚类得到的结果与Gene Ontology注释进行比较,观察属于同一类的基因的Gene Ontology注释是否相似;3)对于在聚类中属于同一类的基因,利用贝叶斯网络对同一类的基因之间的调控关系建模,确定基因间调控网络结构。本发明克服了聚类算法不够精确的缺点以及贝叶斯网络算法速度慢的不足,并且在芯片实验数量相对基因个数显得较少的情况下采用这个方法构建基因间调控网络还是比较适合的。 | ||
搜索关键词: | 基于 模型 聚类法 贝叶斯 网络 基因芯片 数据 分析 | ||
【主权项】:
1.一种结合基于模型的聚类法与贝叶斯网络法的基因芯片数据分析方法,其特征在于,包括如下步骤:1)利用基于模型的聚类方法,根据基因在不同芯片实验中的表达情况将差异表达的基因进行聚类;2)将聚类得到的结果与Gene Ontology注释进行比较,观察属于同一类的基因的Gene Ontology注释是否相似;3)对于在聚类中属于同一类的基因,利用贝叶斯网络这一基于复杂的概率模型对同一类的基因之间的调控关系建模,确定基因间调控网络结构。
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