[发明专利]一种高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别方法无效
申请号: | 200810069933.0 | 申请日: | 2008-07-07 |
公开(公告)号: | CN101308526A | 公开(公告)日: | 2008-11-19 |
发明(设计)人: | 梁桂兆;梅虎;杨力;李志良 | 申请(专利权)人: | 重庆大学 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 400044重*** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | 本发明公开了一种高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别方法,能够用于高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别,可为理解高致病性禽流感病毒血凝素蛋白的结构特征提供参考,通过对血凝素蛋白的识别,从而可以间接地判别其所属的禽流感病毒株的致病性高低,包括如下步骤:a)基于主成分分析方法,建立氨基酸全息拓扑结构得分矢量;b)应用氨基酸全息拓扑结构得分矢量对流感病毒血凝素蛋白的结构进行表征;c)用自交叉协方差方法对每个流感病毒血凝素蛋白的表征变量做归一化处理;d)用径向基核支持向量机建立禽流感病毒血凝素蛋白识别模型;e)用径向基核支持向量机建立高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别模型。 | ||
搜索关键词: | 一种 致病性 禽流感 病毒 血凝素 蛋白 识别 方法 | ||
【主权项】:
1.一种高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别方法,其特征在于包括如下步骤:a)基于主成分分析方法,建立氨基酸全息拓扑结构得分矢量;b)应用氨基酸全息拓扑结构得分矢量对流感病毒血凝素蛋白的结构进行表征;c)用自交叉协方差方法对每个流感病毒血凝素蛋白的表征变量做归一化处理;d)用径向基核支持向量机建立禽流感病毒血凝素蛋白识别模型;e)用径向基核支持向量机建立高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别模型。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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