[发明专利]一种测序序列纠错方法、系统及设备有效
| 申请号： | 200810218340.6 | 申请日： | 2008-12-12 |
| 公开（公告）号： | CN101457253A | 公开（公告）日： | 2009-06-17 |
| 发明（设计）人： | 石仲斌;李瑞强;朱红梅;阮珏;李胜霆;王俊;杨焕明;汪建 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;G06F19/00 |
| 代理公司： | 深圳中一专利商标事务所 | 代理人： | 张全文 |
| 地址： | 518083广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明适用于基因工程技术领域，提供了一种测序序列纠错方法、系统及设备，所述方法包括下述步骤：接收测序序列，根据预设的高频阀值构造高频短串表；遍历接收到的各测序序列，结合所述高频短串表在各测序序列上查找连续为高频短串最多的区域；根据相应接收到的测序序列和所述高频短串表，在查找到的所述区域左侧和/或右侧构造全是高频短串的左序列和/或右序列；根据构造的所述左序列和/或右序列，以及查找到的所述区域还原相应测序序列。在本发明中，根据预设的高频阀值构造高频短串表，结合构建的高频短串表将各测序序列中非连续高频短串区域的序列恢复为连续高频短串区域的序列，提高后续对测序序列进行分析、处理的准确性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 序列 纠错 方法 系统 设备 | ||
【主权项】：
1、一种测序序列纠错方法，其特征在于，所述方法包括下述步骤：接收测序序列，根据预设的高频阀值构造高频短串表；遍历接收到的各测序序列，结合所述高频短串表在各测序序列上查找连续为高频短串最多的区域；根据相应接收到的测序序列和所述高频短串表，在查找到的所述区域左侧和/或右侧构造全是高频短串的左序列和/或右序列；根据构造的所述左序列和/或右序列，以及查找到的所述区域还原相应测序序列。
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