[发明专利]虚拟筛选装置及虚拟筛选方法

摘要

本发明提供虚拟筛选装置，其特征在于，具备对每个候选化合物提取化合物中的多个原子的化合物指纹而制成的化合物的数据库，对已知结合于立体结构和目标蛋白相同或类似的家族蛋白的结合化合物，与转换到目标蛋白的坐标系的三维坐标一同，提取化合物指纹，制作结合化合物指纹集，对存储于化合物数据库的候选化合物，运算该候选化合物的相对于目标蛋白的所述立体结构，使以将结合化合物指纹集的三维坐标作为基础计算的化合物指纹单元的均方偏差为基础的相互作用分值最优化。

主权项

筛选结合于目标蛋白的候选化合物的虚拟筛选装置，其至少具备存储部和控制部，其特征在于，●所述存储部具备化合物数据库，■所述化合物数据库通过提取每个所述候选化合物的包含原子类型和原子间结合规则的化学描述符而制成，■所述化学描述符作为联系化合物中多个原子的化合物指纹而被提取；●所述控制部具备：■化合物指纹制作装置，其将结合化合物的三维坐标与所述化合物指纹一同提取而制作结合化合物指纹集，◆所述结合化合物已知结合于立体结构与所述目标蛋白相同或类似的家族蛋白，◆所述结合化合物的三维坐标是已转换到所述目标蛋白的坐标系的三维坐标，和■最优化装置，其计算使所述候选化合物与所述目标蛋白的相互作用分值最优化的所述候选化合物的立体结构，◆所述候选化合物储存于所述化合物数据库中，◆所述候选化合物与所述目标蛋白的相互作用分值以所述化合物指纹单元的均方偏差为基础，◆所述化合物指纹单元的均方偏差以所述结合化合物指纹集的所述三维坐标为基础计算。