[发明专利]一种通过代谢预测和虚拟筛选发现中药活性成分的方法

摘要

本发明公开了一种通过代谢预测和虚拟筛选发现中药活性成分的方法，该方法包括如下步骤：(1)收集所研究中药的所有已确证结构的化学成分，并对这些化学成分在体内可能产生的代谢产物进行预测；(2)将该中药所含的已确证结构的化学成分和它们的预测代谢产物建立为分子库；(3)根据该中药的功能主治或药理作用建立相应的一个或多个作用靶点的三维结构模型：(4)用软件将分子库和靶点模型进行虚拟对接，对分子库中每一分子的对接结果进行评分，并与参比分子相比较，筛选出虚拟活性为阳性的分子；(5)将虚拟活性为阳性的化学成分进行生物活性实验验证，从而发现代表该中药功能主治或药理作用的活性成分。本发明能全面揭示中药的活性成分。

主权项

一种通过代谢预测和虚拟筛选发现中药活性成分的方法，其特征在于包括以下步骤：预测中药所含化学成分的代谢产物的化学结构收集该中药所含的已确证化学结构的化学成分，通过软件或根据药物代谢理论来预测这些化学成分在生物体内的代谢产物的化学结构；建立分子库用软件将该中药所含的已确证化学结构的化学成分和上述步骤中所得到的各种预测代谢产物构建成分子库；建立作用靶点的三维模型根据该中药的功能主治或药理作用，选择相对应的靶点进行建模，对于待研究靶点，可以直接利用已被实验证实的靶点三维结构模型，也可运用软件通过同源建模方法建立其三维结构模型；虚拟筛选A.用软件将上述步骤所建立的分子库和所建立的靶点分子模型进行虚拟对接，利用评分函数对分子库中的每一分子的对接结果进行评分，同一分子如果存在多个评分，以多个评分的均数为最终评分，所得最终评分的绝对值Si用于结果判断，i为自然数；B.选择对所研究靶点有明确活性的阳性药物或化合物作为参比分子，将其与该靶点分子模型进行虚拟对接，并得到对接评分，该对接评分的绝对值R用于结果判断；C.结果判断：Si≥R×x％，结果为虚拟活性阳性，Si＜R×x％，结果为虚拟活性阴性，所述x％代表相对于参比分子对接评分的比例，根据不同靶点、不同参比分子取不同值，通常x％＞50％；生物活性验证对上述步骤筛选出来的虚拟活性阳性的分子，用体内或体外药理实验进行生物活性验证，凡通过生物活性验证的分子即为该中药所含有的活性成分或该中药所含化学成分代谢后产生的活性成分。