[发明专利]基于贝叶斯网络的基因调控网络构建方法无效
申请号: | 200910239028.X | 申请日: | 2009-12-25 |
公开(公告)号: | CN101763528A | 公开(公告)日: | 2010-06-30 |
发明(设计)人: | 纪震;杜智华;储颖;周家锐 | 申请(专利权)人: | 深圳大学 |
主分类号: | G06N3/12 | 分类号: | G06N3/12 |
代理公司: | 深圳市顺天达专利商标代理有限公司 44217 | 代理人: | 易钊;曾少丽 |
地址: | 518060 广东省深圳市南山*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明涉及一种基于贝叶斯网络的基因调控网络构建方法,通过建立基因调控网络模型对某一物种或组织中的全部基因的表达关系进行整体的模拟分析和研究,建立基因调控网络模型的步骤包括:A,通过具有记忆的二进制粒子群优化算法来识别最佳节点次序,其中通过二进制粒子群优化算法对粒子进行速度更新后,对部分粒子速度进行变异,对搜索空间进行搜索,以跳出局部最优;B,将获得的最佳节点次序作为K2算法的输入,然后执行K2算法学习贝叶斯网络的结构。本发明收敛速度快,运算简单、易于实现等优点,为研究基因转录水平的调控提供线索,更精确的表示出基因调控网络的结构,并且对研究生物学、医学、药学等诸多领域具有重要的理论意义和实用价值。 | ||
搜索关键词: | 基于 贝叶斯 网络 基因 调控 构建 方法 | ||
【主权项】:
一种基于贝叶斯网络的基因调控网络构建方法,通过建立基因调控网络模型对某一物种或组织中的全部基因的表达关系进行整体的模拟分析和研究,其特征在于,建立基因调控网络模型的步骤包括:A,通过具有记忆的二进制粒子群优化算法来识别最佳节点次序,其中通过二进制粒子群优化算法对粒子进行速度更新后,对部分粒子速度进行变异,对搜索空间进行搜索,以跳出局部最优;B,将获得的最佳节点次序作为K2算法的输入,然后执行K2算法学习贝叶斯网络的结构。
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