[发明专利]用于检测和治疗结肠直肠癌的组合物

摘要

本发明提供了鉴定由细胞在第一环境状况下表达但在第二环境状况下不表达的蛋白和多肽及其同源多核苷酸的方法。本发明还提供了用于治疗和检测癌症包括结肠直肠癌的组合物。

主权项

检测受试者中的癌症或患上癌症的倾向性的方法，所述方法包括，测定来自受试者的生物样品中的选自下列的与癌症相关的蛋白、多肽或多核苷酸的表达水平：成髓细胞素前体(例如SEQ ID NO：29)；肌联蛋白；HBA1；胰岛素样生长因子1受体(IGF1R)；带粘蛋白前体的同种型3；潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4)；ASXL1(另外的性梳子样1)；β珠蛋白(HBB)；BMP15‑骨形态发生蛋白；TRIM49；DNAJ同源物亚家族B成员11前体；未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027；未表征的蛋白ALB；含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3；外周蛋白的同种型2；线粒体28S核糖体蛋白S22；翻译起始因子EIF‑2B亚基ε；雌二醇17‑β‑脱氢酶1；XRCC6BP1；脑特异性血管生成抑制剂1前体；含有无名指和CCCH‑型锌指结构域的蛋白2的同种型2；血红蛋白亚基β；远上游元件结合蛋白1的同种型1；半乳糖凝集素‑3；溶菌酶C前体；肌动蛋白，α骨骼肌的；丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2；AGR2；中性粒细胞防御素1前体；未表征的蛋白PSME2；微管蛋白β‑2C链；硫代硫酸盐转硫酶；热休克70kDa蛋白1；Igκ链V‑Ⅲ区sie；巨噬细胞迁移抑制因子；ATP合酶亚基D的同种型1，线粒体的；未表征的蛋白ENSP00000374051；细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP]；血红蛋白亚基δ；剪接因子的同种型1，富含精氨酸/丝氨酸的7；mRNA加帽酶的同种型1；LON蛋白酶同源物，线粒体前体；信号识别颗粒54kDa蛋白；半乳糖凝集素‑9的长同种型；整联蛋白连接的蛋白激酶；双功能氨酰‑tRNA合成酶；锌指蛋白207的同种型1；无机焦磷酸酶；调宁蛋白‑2；盲肌样蛋白3的同种型1；组织蛋白酶G前体；含有锌指和BTB结构域的蛋白34；腺嘌呤磷酸核糖转移酶；40S核糖体蛋白S9；TALIN‑1；含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59；ATP合酶亚基α，线粒体前体；蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7；二羟基丙酮激酶；类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNPC1/HNRNP C2)同种型4的蛋白；18kDa的蛋白(例如，UNIPARC登录号IPI00796554)；寒冷凝集素FS‑1 L‑链；异质核核糖核蛋白d0的同种型1；DAZAP1/MEF2D融合蛋白；POTE2；角蛋白18(KRT18)；蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1；丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33)；补体组分1，s亚组分(C1S)；溶菌酶C前体(LYZ)；角蛋白型细胞骨架20(KRT20)；RNASE3；醛脱氢酶X，线粒体前体(ALDH1B1)；CDNA FLJ25506 fis，克隆CBR05185；fibulin‑1前体(FBLN1)的同种型B；核结合蛋白1(NUCB1)；组蛋白簇2，H2ba(HIST2H2BA)；含有三部分基序的28(TRIM28)；过氧化物酶体D3，D2‑烯脂酰辅酶A异构酶(PECI)；肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB)；与40S核糖体蛋白S17类似的；真核翻译延伸因子1γ(EEF1G)；角蛋白8(KRT8)；Fibulin 2(FBLN2)；VIM；纤维蛋白原α链(FGA)；膜联蛋白A2(ANXA2)；H2A组蛋白家族，成员J(H2AFJ)；肌动蛋白α，心肌1(ACTC1)；角蛋白19(KRT19)；免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白)；免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM)；含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1)；含有三部分基序的蛋白34；AP1‑亚基γ结合蛋白1的同种型3；Proflin‑1；组蛋白H4；血红蛋白亚基α；转凝蛋白)；基膜聚糖前体；血红蛋白β；纤维蛋白原β链前体；免疫球蛋白κ恒定(IGKC)；未表征的蛋白ALB；ApoA1；C4A；C3 187kDa蛋白；细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β)；血红蛋白β；血红蛋白亚基α；POTE‑2α肌动蛋白；SLC4A10；核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7)；核RNA输出因子1(NXF1)；具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原，UACA；未表征的蛋白C13ORF27；含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3；动力蛋白重链10的同种型1，纤毛轴的(DNAH10)；间隙连接α‑1蛋白(GJA1/Connexion 43)；驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1；GAPDH‑甘油醛‑3‑磷酸脱氢酶；未表征的蛋白ALB；半乳糖凝集素‑3，LGALS3；与含有NAC‑α结构域的蛋白1(NACADA)类似的；线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶，ACAT1；KH型剪接调控蛋白，FUBP2；Profilin 1(PFN1)；细胞内氯通道蛋白1，CLIC1；锌指蛋白831；内质蛋白；核糖体蛋白S10(RPS10)；剪接因子，富含精氨酸/丝氨酸的3；ACTA2蛋白(α肌动蛋白，平滑肌)；钠通道蛋白8型亚基α的同种型1，SCN8A；半乳糖凝集素‑9的长同种型；T‑复合蛋白1亚基ε，CCT5；肺特异性的α‑烯醇酶；原癌基因丝氨酸/苏氨酸‑蛋白激酶MOS；β‑内收蛋白(ADD2)的同种型1；载脂蛋白E(APOE)；泛素‑4(UBQLN4)(ataxin‑1泛素样相互作用蛋白)；Sumo‑缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物)；肌球蛋白‑15(MYH15)；FLJ93091，智人UMP‑CMP激酶(UMP‑CMPK)；Intelectin‑1(ITLN1)；载脂蛋白A‑IV(APOA4)；线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1)；含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59)；60S核糖体蛋白L37A(RPL37A)；尿苷‑胞苷激酶1‑样1(UCKL1)；醛脱氢酶9A1(ALDH9A1)；细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1)；核受体亚家族2组E成员1(NR2E1)；阳离子通道精子相关蛋白3(CATSPER3)；含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1)；蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF‑X1(NFX1)的同种型1，或其任意组合；其中与对照样品相比，所述生物样品中的与癌症相关的蛋白、多肽或多核苷酸的表达水平的升高指示该受试者患有癌症或具有患上癌症的倾向性。