[发明专利]一种通用寡核苷酸序列库的构建及应用无效
| 申请号： | 201010120887.X | 申请日： | 2010-03-10 |
| 公开（公告）号： | CN102191311A | 公开（公告）日： | 2011-09-21 |
| 发明（设计）人： | 雷向东;魏崟泷 | 申请（专利权）人： | 常州楚天生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C40B40/06 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 213022 江苏省常州市*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种通用寡核苷酸序列库的构建及应用。传统遗传信息分析通常采用“一对一”的模式，如一条探针分析一个基因。这种模式的缺点和局限在于：缺乏通用性，成本高昂；从高度复杂的基因库直接到单一基因，无法对基因库进行分组分析；需要知道至少16个碱基的序列。本发明通过生物信息学的手段对多个已测序的物种进行序列分析，构建通用寡核苷酸序列库，克服传统“一对一”模式的局限。本发明的通用寡核苷酸序列库可应用于如下领域：作为分析探针用于实时荧光PCR；作为捕获探针用于DNA矩阵列、DNA固态芯片、基于磁珠或其它基质的液体芯片；作为通用引物启动一组带有该引物序列的RNA的反转录或DNA的复制。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 通用 寡核苷酸 序列 构建 应用 | ||
【主权项】：
一种构建通用寡核苷酸序列库的方法，其特征在于：对于可作为探针、引物的一类寡核苷酸序列，在目标序列集的中统计它们的出现频率，得到高频备用寡核苷酸序列库。后通过贪婪算法对高频序列库中的每条序列及不同的序列组合进行分布分析，利用最少的寡核苷酸序列达到对目标序列集最大的覆盖率，并保证探针分布的均匀性和分布密度，这样的一组寡核苷酸序列即构成通用序列库。
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