[发明专利]一种基于PCR的低成本、简单、高效的SNP检测方法

摘要

本发明提供了一种基于PCR的低成本，简单、高效的SNP检测方法；该方法能一次检测多个SNP，检测效率高，特异性好。本发明针对不同SNP的不同等位基因设计长度特异的引物；通过生物信息学算法优化PCR引物和实验方案，使得PCR反应能够高效的多重化，并最大程度地消除引物间的相互干扰和非特异性扩增；最终，多个SNP的不同等位基因都可以通过简单检测PCR产物长度清楚地、特异地区分开，因此PCR检测的效率和可靠性得到最大化。与现有的基因芯片，Infinium等大规模检测方法相比，本发明设备要求简单，成本低，对于针对一组数目不大的SNP的低成本的检测需要，本发明的方法具有优越性。

主权项

一种基于PCR的用于检测SNP的方法，其特征在于，a)每个SNP的每个等位基因都有一个特异的引物和相对应的长度唯一的PCR产物；b)针对检测中采用的DNA检测手段的特性，寻找一种优化的PCR产物长度分配方案，以增大检测SNP的数目；c)根据设计的PCR产物长度分配方案及待测SNP，按一定算法，逐个地设计和优化所有SNP的PCR引物。