[发明专利]通过模型预测流感抗原的方法及应用

摘要

本发明公开了一种通过模型预测流感抗原的方法及应用，通过抽提影响流感抗原的12个特征：五个抗原决定簇氨基酸的突变个数、HA蛋白氨基酸的五个理化特性、影响受体结合因素、糖基化位点改变的个数，氨基酸五个理化特性包括疏水性、体积变化、带电性、极性、可积表面积，并对3681对已知的抗原相似的病毒对和1720对抗原变异的病毒对的上述12个特征进行统计，建立一个抗原关系的预测模型，单纯从序列出发，就能给出病毒之间的抗原关系，简单、方便、灵敏度高。通过网络的方式能够形象的展示抗原进化的过程，用于揭示流感传播规律和筛选疫苗候选株等。

主权项

1.一种通过模型预测流感抗原的方法，其特征在于，包括通过以下表1和式(1)构建的模型预测两两病毒之间抗原相似还是抗原变异：抽提影响流感抗原的12个特征：五个抗原决定簇氨基酸的突变个数、HA蛋白氨基酸的五个理化特性、影响受体结合因素、糖基化位点改变的个数，所述HA蛋白氨基酸的五个理化特性包括疏水性、体积变化、带电性、极性、可积表面积；对3681对已知抗原相似的病毒对和1720对抗原变异的病毒对的上述12个特征进行统计，得到：表1：表1中的数据分别表示抗原相似病毒对的特征改变大和小的数量及抗原变异病毒对的特征改变大和小的数量；Poddsratio=1723682(36831722)12×Πj=1121+Σyi=1x~ij1+Σyi=0x~ij,x~ij=xij,ifXj,new=11-xij,ifXj,new=0---(1),]]>式中：P_odds ratio表示优胜率，P_odds ratio＜1时被预测的病毒对抗原相似，P_odds ratio＞1时被预测的病毒对抗原变异；X_j，new表示待预测的病毒对的第j个特征改变情况，X_j，new以及P_odds ratio通过以下方法计算：首先，分别对所述影响流感抗原的12个特征进行量化，并分别取以下阈值0、2、0、1、0、1.82、54.667、2.493、34.867、0.098、113.607、1；然后，对被预测病毒对的12个特征分别进行比较计算，当二者的特征差异小于其对应的阈值时，X_j，new＝0，对应表1第j个特征在抗原相似的病毒对中特征改变小的数量，对应表1第j个特征在抗原变异的病毒对中特征改变小的数量；当二者的差异大于或等于其对应的阈值时，X_j，new＝1，对应表1第j个特征在抗原相似的病毒对中特征改变大的数量，对应表1第j个特征在抗原变异的病毒对中特征改变大的值。