[发明专利]一种microRNA编码区靶基因预测的方法无效
| 申请号： | 201010190174.0 | 申请日： | 2010-06-01 |
| 公开（公告）号： | CN102270282A | 公开（公告）日： | 2011-12-07 |
| 发明（设计）人： | 曾华宗 | 申请（专利权）人： | 上海聚类生物科技有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/14 | 分类号： | G06F19/14;C12Q1/68 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 200333 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明涉及一种microRNA靶基因预测的方法，适用于microRNA位于基因编码区的靶基因的预测。本发明包括如下流程：步骤1，建立待研究生物的编码区序列数据库；步骤2，与其他物种编码区序列进行序列比对，寻找保守区段；步骤3，设计靶基因预测程序，并进行编译和调试；步骤4，对于每一个microRNA，扫描所有基因的编码区，从保守序列中获得结合位点；步骤5，靶基因的统计及查询；步骤6，实验验证。该方法的优点在于：实施简单、结果可靠性高，能满足大部分microRNA编码区靶基因预测的需要。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 microrna 编码 基因 预测 方法 | ||
【主权项】：
一种基于已有序列数据库及计算机软件辅助的、预测microRNA编码区靶基因的新方法，其主要特征在于：步骤一、建立待研究生物的编码区序列数据库步骤二、与其他物种编码区序列进行序列比对，寻找保守区段步骤三、设计靶基因预测程序。进行编译和调试步骤四、对于每一个microRNA，扫描所有基因的编码区，从保守序列中获得结合位点步骤五、靶基因的统计及查询步骤六、实验验证。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于上海聚类生物科技有限公司，未经上海聚类生物科技有限公司许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201010190174.0/，转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 专利分类
G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
