[发明专利]一种构建基因相互作用网络的方法无效
申请号: | 201010214005.6 | 申请日: | 2010-06-29 |
公开(公告)号: | CN102270208A | 公开(公告)日: | 2011-12-07 |
发明(设计)人: | 曾华宗 | 申请(专利权)人: | 上海聚类生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F17/30 | 分类号: | G06F17/30;G06Q50/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200333 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明所述的方法的一大特点便是将NLP技术用于研究基因之间的相互作用关系,并以此构建基因相互作用网络,该方法实施的基本流程为:步骤1、文档搜索及格式化;步骤2、将文档分离成单个句子,作为后续分析基本单位;步骤3、基因描述的定位;步骤4、统一基因描述中使用的基因符号;步骤5、建立基因互作动词词典;步骤6、生成需要研究基因的同义词字典,并从上述句子中提取出基因的描述;步骤7、统计分析基因名、基因互作动词和需要研究的基因同时出现的句子,整理成列表;步骤8、构建相互作用关系网络。 | ||
搜索关键词: | 一种 构建 基因 相互作用 网络 方法 | ||
【主权项】:
本发明专利所述的一种构建基因相互作用网络的方法,其主要特征如下:步骤1、文档搜索及格式化。步骤2、将文档分离成单个句子,作为后续分析基本单位。步骤3、基因描述的定位步骤4、统一基因描述中使用的基因符号。步骤5、建立基因互作动词词典步骤6、生成需要研究基因的同义词字典,并从上述句子中提取出基因的描述。步骤7、统计分析基因名、基因互作动词和需要研究的基因同时出现的句子,整理成列表。步骤8、构建相互作用关系网络。
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