[发明专利]一种Bcr-Abl基因突变检测液相芯片

摘要

本发明公开了Bcr-Abl基因突变检测液相芯片，所述液相芯片包括针对每种突变位点分别设计的野生型和突变型ASPE引物对、分别包被有特异的anti-tag序列的微球，和用于分别扩增具有M244V、L248V、D276G、G250E、Y253F/H、E255K/V、T315I、F317L、E355G、F359V、V379I、H396P/R、和/或F486S突变位点的Bcr-Abl基因目标序列的引物。所制备的Bcr-Abl基因突变检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比，并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应。本发明设计的ASPE引物具有非常好的特异性，能准确区分各种类型的突变位点。所述检测方法步骤简单，16种突变位点可以一步检测完成，操作方便，并且避免了多次操作过程中存在的诸多不确定因素，因而可大大提高检测准确率。

主权项

一种Bcr‑Abl基因突变检测液相芯片，其特征在于，主要包括有：(A)针对Bcr‑Abl基因每种突变位点分别设计的野生型和突变型ASPE引物对：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列选自：SEQ ID NO.32及SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34及SEQ ID NO.35、SEQ ID NO.36及SEQ ID NO.37、SEQ ID NO.38及SEQ ID NO.39和SEQ ID NO.40、SEQ ID NO.41及SEQ ID NO.42和SEQ ID NO.43、SEQ ID NO.44及SEQ ID NO.45、SEQ ID NO.46及SEQ ID NO.47、SEQ ID NO.48及SEQ ID NO.49和SEQ ID NO.50和SEQ ID NO.51、SEQ ID NO.52及SEQ ID NO.53、SEQ ID NO.54及SEQ ID NO.55、SEQ ID NO.56及SEQ ID NO.57、SEQ ID NO.58及SEQ ID NO.59和SEQ ID NO.60、和SEQ ID NO.61及SEQ ID NO.62中的一对或多对；所述tag序列选自SEQ IDNO.1～SEQ IDNO.31中的序列；(B).分别包被有特异的anti‑tag序列的、具有不同颜色编码的微球；所述anti‑tag序列选自SEQ ID NO.63～SEQ ID NO.93中的序列，所述anti‑tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对，且所述anti‑tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；(C).用于扩增具有M244V、L248V、G250E、Y253F/H、E255K/V、D276G、T315I、F317L、E355G、F359V、V379I、H396P/R、和F486S中的一个或多个突变位点的Bcr‑Abl基因目标序列的扩增引物。