[发明专利]石蒜微卫星分子标记有效

专利信息
申请号: 201010536252.8 申请日: 2010-11-09
公开(公告)号: CN101988063A 公开(公告)日: 2011-03-23
发明(设计)人: 朱国萍;宣守芹;王晖;郑基阳;高鹏;李雪 申请(专利权)人: 安徽师范大学
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11
代理公司: 芜湖安汇知识产权代理有限公司 34107 代理人: 谢世红
地址: 241000 安徽省*** 国省代码: 安徽;34
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摘要: 发明公开了石蒜微卫星DNA分子标记,包括石蒜微卫星(CT)n富集文库的构建,微卫星序列阳性克隆的筛选及测序,得到33个含有微卫星DNA的克隆,确定了10个多态性丰富的微卫星分子标记Lyra-1、Lyra-2、Lyra-3、Lyra-4、Lyra-5、Lyra-6、Lyra-7、Lyra-8、Lyra-9、Lyra-10。本发明可用于研究石蒜的遗传多样性保护,石蒜属植物种间和居群间的变异和进化关系及石蒜的品种鉴定;重复性好,是一种可靠有效地分子标记。
搜索关键词: 石蒜 卫星 分子 标记
【主权项】:
一种石蒜微卫星DNA分子标记,其特征在于,所述微卫星标记的标号分别为:Lyra‑1、Lyra‑2、Lyra‑3、Lyra‑4、Lyra‑5、Lyra‑6、Lyra‑7、Lyra‑8、Lyra‑9、Lyra‑10,其核苷酸序列分别为:Lyra‑1:gatcagacct tactgcaagg atggaatttt gaggggtcga tatacaaaat gtctgtcttc  60tcaacttaaa ctctcaaaac tctctctctc tctctctcat ctctctttcc cgctcttttc  120tctctccatc tctgttcacc tttaccctct cactctctct ctctctctct ctctctctct  180ctctactctc aagacagctc aagatggctg cggagacaag ggtctaagag cttgagatgt  240tgggttcgtg gtgaagtggt cggggaaggt cggcgtggga gctcgagatt ggagttgagg  300ctgtggggct gagctgggac tgaaggat                                     328Lyra‑2:gatcaagatt tgtttcatgc taatttaacc ctaaaaccca agatctacct agccctagat  60gctgtcgccg accctttctt atgcccatcg ccgctactat caccataatc ccccttgctg  120tgtgcatgcc cctcccttct ttttctcctc atcttctctc tctctctctc tctctctttc  180tctctctctc tctctctctc tctctctctc tctctctctc tctcccctcc attatcttct  240ctctcttctg tccttgcgtc gcaccccttt gcgtcgccga tctgtagttg ataccctctt  300ctcctttgcc ttcgatcgct tcctaccccc aaagattgag gctgctacca taaaacccta  360ggttcccctc gatctttatg cacgtgcact tgtgcacccc cttcatggaa atcccgatgc  420ccccttcatg caagtttcga tgccctttca tgtcactccc gctctaagt              469Lyra‑3:aatcagacac cccacggatc caaacattgt tccagagcct tctcccccaa tgttcactac  60caccccagct ctctctctct ctctctctct ctctctctct ctctctctct ctctctccct  120ctccccctcc aaccctagta gcttaagctt caaggtggtc aggccaggct cgaacagcag  180cagaagctct ctctctctct ctctctcacc cttcttgctg aatttagaac agcttaagga  240agtctgccca tataaagctg ccacattatc caccgagtac tcctgaaacc aaaaccttca  300tttcaaaaca ttattagact gagaatatca tcaattataa gattcagtgg tctacatatg  360ttttgaaaca atcttttatt tctttcgccc cgcaaaccgt aagcacaggc caaaacacat  420gtatcatatc tgcccctct                                               439Lyra‑4:gatcatcttc cccaagcctt ttttctcgag tccttgctca cgactccttt actctttctc  60tctcatatca ctctctctta ccattttctc tcagctcgat ctctctctct ctctctttct  120ctatctctct ctctctctct ctctctctct ctctctctct cttccgcacg ctctcttctc  180tcatatctca ctgtgaactt actctcttac tcctctctcc tcaccattct ttgctctcac  240ggcttcaact actcctcctt tctctcgcat acattctcac ttcatgggtt tgatggcaag  300cttggaggtt gagctcatag ggactttgag atgaaggtgg caacagcatt gggggtgctc  360gagctcaagc tgaggatggt atgaggtggt ggagcttcga gagatgaagt tgaaggagga  420gatgggtcag aactatgctg gtggagttca tcaaagttgg gttcaagctc gactgtgaga  480aaaactcgat aaggaagaag ctcgagttgg ggtagtgagt tgcagacgaa ttcgactt    538Lyra‑5:gatcatcatc gtgtttgcta gttatttgcc agtccttata tagaagaatg acagggaaga  60aagagtttcg actttcgagt ttatggttac tcttaccttc tttggctact cacatgcttg  120tcactttctt tgtatacagc ctacactgat actctctagc catttctcag ggtacaatct  180ctctctctct ctctctctct ccctctctct ctctctcatt ttggaacatt ttgttaaact  240ttttagtagc tcgccctctt attttataac ttttgttaaa attttaagta gcatcttttg  300gagaagagcg tagtagcttt gacgggatcc ttgcgatttt tacgcttggt caatagcgtt  360atgcaagagg atggactgac tgtgaggcta gcaggataac tcgatatgat tagacaaagg  420cggagaacaa gt                                                      432Lyra‑6:gatcaattgg ctaggacttg taaaatgaat tttagaattg tcctctttag tccctaaacc  60ttcgtgcgtc cgctacgcca ttaaattgtt tagaaatcct ctaccaaaac ccaacatccc  120ctccccgaac tatgccgcca ccgaaaaacc aaccaactcc tctagccagc ggcaagcccc  180cctcctttgt tgtcgtcgaa ggcggcaccc ccttgtcgtc tctctctctc tctctctctc  240tctccctaaa cctattttcc ttttctttct ttagttttgg tttggtccat gagttcacat  300ctctctctct ctctctcaaa gcagcaaatc caactccatt ctcatctctc tctctctctc  360tctctctctc tctctctctc tcatccaacg agtaaattag cggcggtgag aagcgaaaca  420at                                                                 422Lyra‑7:gatcagagat tagtataacg attccatcta aataatgaac caaaatgatt aaatgtaaag    60tgggtgatga aatgaactgg ataaataaag gcttgaatat catcaacaag ggaaccctac    120taagactatt aaagcagctt aggaatttta agagagaaat gttactctaa gtcaatgcat    180tcaattctgt cagagagaga gagagagaga gagagagaga gagagagaga ataataataa    240cagggcgacg aattatggtt agccggcgat gaactcaaca atgcgggagg ggaggggagg    300ggagggtggc aataggagta cctgttgaag aaaagagtgg gtattgagct taaacaacca    360ttgagatagt agagaaagag aaagggcaat tcgatctaaa gtcaatgggg tattgggcaa    420cggagcaaat attaagggtg cttttaaaca tcaagtgaat gtcaaggtag tttctagaca    480ttaggcctaa aagtaggatg gtttttggat aataccccat ttatgttatc aaattgctag    540tttggat                                                              547Lyra‑8:gatcagccct atcaccacca ttagagctcg accttattaa tgaccattac tatggtgacc    60tctgaacctc atcaactcca accacccttt aaccattgca ctaagctcag tcgctaaact    120aagccctatc ttcaacatga actccaccac ctcaatggca gacctctctc attcttcaaa    180gcttcaaacc cctaatccat gagcttgcac ttcccatcca tgatccatgc tgaagagaga    240gagagaggga gagggagagg gagagggaga gagagagaga gagagagaga gagagagaga    300gagaacttag tagtagagag aagaaaaatg aaatcaagtg agagagaaag aggaaggcaa    360gttgtgggtg cactttagct gagggcatga tggagaagat                          400Lyra‑9:gatcagccct atcaccacca ttagagctcg accttattaa tgaccattac tatggtgacc    60tctgaacctc atcaactcca accacccttt aaccattgca ctaagctcag tcgctaaact    120aagccttatc ttcaacatga actccaccac ctcaatggca gacctctctc attcttcaaa    180gcttcaaacc cctaatccat gagcttgcac ttcccatcca tgatccatgc tgaagagaga    240gggagaggga gagggagagg gagagg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