[发明专利]一种分析iTRAQ数据的方法无效
申请号: | 201010546063.9 | 申请日: | 2010-11-15 |
公开(公告)号: | CN102321733A | 公开(公告)日: | 2012-01-18 |
发明(设计)人: | 曾华宗 | 申请(专利权)人: | 上海聚类生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N33/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200333 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明针对iTRAQ蛋白质定量分析数据的特点,设计了一种分析iTRAQ数据的方法,其主要流程为:步骤一、差异蛋白筛选,通过对原始iTRAQ数据进行分组筛选,获取差异结果;步骤二、GO分析,通过向GO数据库进行映射查询,获取较全面的基因功能信息,以有向无环图显示;步骤三、Pathway分析,与GO分析类似。通过与KEGG数据库进行比较查询,构造基因之间相互作用通路;步骤四、Gene network分析,通过整合3种不同的相互作用关系,得到基因互作网络图。 | ||
搜索关键词: | 一种 分析 itraq 数据 方法 | ||
【主权项】:
本发明所述一种分析iTRAQ数据的方法,它包含如下几步主要特征:步骤一、差异蛋白筛选,通过对原始iTRAQ数据进行分组筛选,获取差异结果;步骤二、GO分析,通过向GO数据库进行映射查询,获取较全面的基因功能信息,以有向无环图显示;步骤三、Pathway分析,与GO分析类似。通过与KEGG数据库进行比较查询,构造基因之间相互作用通路;步骤四、Gene network分析,通过整合3种不同的相互作用关系,得到基因互作网络图。
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