[发明专利]利用L-EDA筛选卵巢癌体液预后标记物的方法有效
申请号: | 201010558383.6 | 申请日: | 2010-11-25 |
公开(公告)号: | CN102478562A | 公开(公告)日: | 2012-05-30 |
发明(设计)人: | 林晓惠;陈静;张洋;陈世礼;黄强;路鑫;许国旺 | 申请(专利权)人: | 中国科学院大连化学物理研究所;大连理工大学 |
主分类号: | G01N30/88 | 分类号: | G01N30/88 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人: | 马驰 |
地址: | 116023 *** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | 本发明公开了一种利用改进的分布估计算法(L-EDA)从体液代谢组轮廓筛选卵巢癌预后标记物的方法。采用液相色谱质谱联用仪对体液代谢物进行分析得到代谢组轮廓,构建概率分布模型对代谢组轮廓进行分析,筛选潜在的卵巢癌预后标记物。不同于传统的分布估计算法,L-EDA对迭代搜索过程中生成的候选属性子集的大小加以限定,并给出一种新的概率分布模型更新策略,使得对于属性的评价更为精确、合理,同时提高了算法的执行效率。L-EDA筛选出的属性子集能够体现代谢组轮廓数据各个组别之间的特征,构建支持向量机(SupportVectorMachine,SVM)分类模型进行交叉验证分析,正确率达到99.06%。 | ||
搜索关键词: | 利用 eda 筛选 卵巢癌 体液 预后 标记 方法 | ||
【主权项】:
利用L‑EDA筛选卵巢癌体液预后标记物的方法,其特征在于:采用液相色谱质谱联用仪分别对健康妇女、卵巢癌患者、卵巢癌术后未复发妇女、卵巢癌术后复发患者的体液代谢物进行分析得到代谢组轮廓,将代谢组轮廓利用L‑EDA算法构建变量的概率分布模型,通过迭代抽取2个或3个以上属性集合、交叉验证来更新该分布模型,最终得到其属性重要性排序列表,并根据该列表进行Wilcoxon秩和检验筛选出潜在卵巢癌预后标记物集合。
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