[发明专利]一种基于病毒基因组序列的微小核糖核酸基因从头预测控制方法无效
| 申请号： | 201010567993.2 | 申请日： | 2010-12-01 |
| 公开（公告）号： | CN102010912A | 公开（公告）日： | 2011-04-13 |
| 发明（设计）人： | 吴剑丙;王慧中;陈喆 | 申请（专利权）人： | 杭州师范大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;G06F19/00 |
| 代理公司： | 杭州天正专利事务所有限公司 33201 | 代理人： | 王兵;王利强 |
| 地址： | 310036 浙江*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 一种基于病毒基因组序列的微小核糖核酸基因从头预测控制方法，包括以下步骤：步骤一：获取病毒基因组序列；步骤二：建立编码区序列数据库：通过将所有已知的编码蛋白的序列整理成数据库，并比对到病毒基因组序列上，获得基因组上的坐标位置；步骤三：从基因组序列内去除编码区序列，获得基因间非编码序列和编码区的反义序列，建立非编码区序列数据库；步骤四：提取非编码区序列的发卡环结构；步骤五：利用核糖核酸二级结构折叠软件生成二级结构；步骤六：计算二级结构自由能，筛选合格微小核糖核酸前体；步骤七：预测微小核糖核酸成熟体序列。本发明能缩短周期、提高效率、预测结果更加可靠。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 病毒 基因组 序列 微小 核糖核酸 基因 从头 预测 控制 方法 | ||
【主权项】：
一种基于病毒基因组序列的微小核糖核酸基因从头预测控制方法，其特征在于：所述预测控制方法包括以下步骤：步骤一：获取病毒基因组序列；步骤二：建立编码区序列数据库：通过将所有已知的编码蛋白的序列整理成数据库，并比对到病毒基因组序列上，获得基因组上的坐标位置；步骤三：从基因组序列内去除编码区序列，获得基因间非编码序列和编码区的反义序列，建立非编码区序列数据库；步骤四：提取非编码区序列的发卡环结构；步骤五：利用核糖核酸二级结构折叠软件生成二级结构；步骤六：计算二级结构自由能，筛选合格微小核糖核酸前体；步骤七：预测微小核糖核酸成熟体序列。
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