[发明专利]一段人乳头状瘤病毒58亚型DNA序列及其应用

摘要

本发明涉及一段人乳头状瘤病毒58亚型DNA序列及其应用，属于生物医学技术领域。本发明采用生物信息学手段和PCR方法，通过基因数据库资料的搜索和分析，确定了一段人乳头状瘤病毒58亚型的特异性，通过PCR扩增克隆了该序列。该序列长度为227bp，作为乳头状瘤病毒检测的靶序列。用该序列建立PCR和基因芯片检测方法诊断乳头状瘤病毒58亚型。本发明与现有技术相比，优点在于：本发明涉及的序列与PCR检测和基因芯片技术相结合，应用于临床样品的核酸检测，实现在人乳头状瘤病毒感染的分型检测中HPV58亚型的准确分型和定位。特别是在基因芯片的应用中，配合基因芯片高通量的特点，实现了一次取样、单次操作完成多项检测。极大的提高了检测的准确性和效率。

主权项

一段人乳头状瘤病毒58亚型DNA序列，其特征在于：a.采用生物信息学分析和PCR扩增，获得一段HPV58亚型的特异DNA片段，该片段共227bp，其序列如下：caaatgcagg caaagattca cgatggccat atttgcacag tagactaaca gtatttgaat    60ttaacaatcc atttccattt gatgcaaatg gtaatccagt gtataaaata aatgatgaaa    120attggaaatc ctttttctca aggacgtggt gcaaattagg cttaatagag gaagaggaca    180aggaaaacga tggaggaaat atcagcacgt ttaagtgcag tgcagga                  227；b.该序列的检测引物序列为：检测上游引物5’‑caaatgcaggcaaagattca‑3’检测下游引物5’‑tcctgcactgcacttaaacg‑3’；c.探针制备引物序列为：探针制备上游引物5’‑gatggccatatttgcacagt‑3’探针制备下游引物5’‑ttcctccatcgttttccttg‑3’。