[发明专利]发现曲线分析系统及其程序有效
申请号: | 201080012005.6 | 申请日: | 2010-03-16 |
公开(公告)号: | CN102349075A | 公开(公告)日: | 2012-02-08 |
发明(设计)人: | 矢野健太郎;清水顕史 | 申请(专利权)人: | 学校法人明治大学;公立大学法人滋贺县立大学 |
主分类号: | G06F19/20 | 分类号: | G06F19/20 |
代理公司: | 北京市德恒律师事务所 11306 | 代理人: | 陆鑫;高雪琴 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | 本发明提供一种发现曲线分析系统,即通过通常的计算机高速地分析从下一代高速时序产生器、类似的实验方法等得到的大量的发现曲线数据,将遗传基因的发现模式可视化,容易地对新遗传基因是否具有与任意的遗传基因接近的功能进行分析。本发明的发现曲线分析系统是对遗传基因的发现曲线数据进行分析的发现曲线分析系统,包括:存储部件,与评价遗传基因对应地,将遗传基因的多个发现条件的每一个的从评价对象的每个评价遗传基因中发现的mRNA的计数数目存储为发现数据;对应分析处理部件,针对每个评价遗传基因,从存储部件中读出发现数据,根据发现数据的每个发现条件的计数数目,进行对应分析;坐标变换处理部件,根据通过对应分析所得到的n(n是自然数)维的分数,将各评价遗传基因变换为配置为m(m是自然数,m≤n)维的坐标值;图像处理部件,描绘为与每个遗传基因对应的坐标值而显示在图像显示部件上。 | ||
搜索关键词: | 发现 曲线 分析 系统 及其 程序 | ||
【主权项】:
一种发现曲线分析系统,是对遗传基因的发现曲线数据进行分析的发现曲线分析系统,其特征在于,包括:存储部件,与评价遗传基因对应地,将遗传基因的多个发现条件的每一个的从评价对象的所述评价遗传基因中发现的mRNA的计数数目存储为发现数据;对应分析处理部件,针对每个所述评价遗传基因,从所述存储部件中读出所述发现数据,根据发现数据的每个发现条件的计数数目,进行对应分析;坐标变换处理部件,根据通过对应分析所得到的n维的分数,将各评价遗传基因变换为配置为m维的坐标值,其中,n是自然数,m是自然数,m≤n;图像处理部件,描绘为与每个所述遗传基因对应的坐标值而显示在图像显示部件上。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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