[发明专利]通过解链曲线分簇的SNP检测

摘要

提供了用于对解链曲线集合进行自动分析的系统、方法和装置。该分析可标识解链的双链核苷酸序列(例如，DNA或其他核苷酸序列)的某些特性。例如，可从该分析确定序列(也称为扩增子)中的变异(例如，突变)。扩增子可经由任何扩增机制来扩增，诸如PCR或连接酶链式反应(LCR)。该自动分析可包括标识解链区，规范化解链曲线、以及将解链曲线分簇。

主权项

一种标识核苷酸序列之间的序列变异的方法，所述方法包括：接收多个数据点集合，每个集合对应于包含两个核苷酸序列的双链分子的副本的不同样本，集合的每个数据点包括所述样本的信号值和温度值，其中所述温度对于每个相继数据点上升，其中每个集合定义一条解链曲线；至少一个处理器通过以下步骤确定各解链曲线的解链区：对于每条解链曲线：取二阶导数；标识所述二阶导数的函数与边界阈值交叉处的开始和结束温度；基于所述各解链曲线的相应开始温度，标识解链区开始；基于所述各解链曲线的相应结束温度，标识解链区结束；将每条解链曲线指派给相应的簇，其中指派给相同簇的解链曲线相对于其他簇中的解链曲线在所述解链区中具有一种或多种相似性质；以及将与至少一簇相对应的所述核苷酸序列的至少一部分标识为相对于另一簇的所述核苷酸序列具有序列变异。