[发明专利]基于分子标签的集合的生物标志物有效

专利信息
申请号: 201080021694.7 申请日: 2010-05-18
公开(公告)号: CN102439600A 公开(公告)日: 2012-05-02
发明(设计)人: A·贾内夫斯基;V·瓦拉达恩;N·班纳吉 申请(专利权)人: 皇家飞利浦电子股份有限公司
主分类号: G06F19/18 分类号: G06F19/18
代理公司: 永新专利商标代理有限公司 72002 代理人: 黄云铎;陈松涛
地址: 荷兰艾*** 国省代码: 荷兰;NL
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摘要: 提供了一种形成生物学数据的新型标签的方法(10)。所述方法包括基于趋势值对特征排列,所述趋势值是基于通过模式发现方法识别出的多个标签创建的。此外,还提供了执行根据所述方法(10)的步骤的装置(30)和计算机程序产品(40)。还提供了所述方法在临床数据的统计学分析、基于多个分子标签的化验设计和基于多个分子标签的化验解释方面的使用。
搜索关键词: 基于 分子 标签 集合 生物 标志
【主权项】:
一种用于基于对生物学数据的多个标签的集合进行分析来形成包括若干特征(F={F1,F2,…,Fn})的生物学数据的新型标签的方法(10),所述方法包括以下步骤:通过对生物学数据运行N次特征子集选择算法来获得(110)所述生物学数据的多个标签的集合,并且对于若干次运行({r1,r2,…,rN})中的每次运行(ri)而言:形成(120a)具有尺寸(F×F)的第一矩阵(Mi),其中,在运行ri中所述第一矩阵(Mi)的每个矩阵元(i,j)基于每个对应的特征对(FiFi)在受分析标签中的共同出现来量化所述特征对;以及形成(120b)具有尺寸(F×N)的第二矩阵(T),其中,所述第二矩阵(T)的每个元(T(i,j))被分配以对应的第一矩阵(Mi)的对应行(Fi)的和;形成(130)具有尺寸(F)的向量(C),其中,所述向量的每个元(CFi)被分配以所述第二矩阵(T)的所有列(1到N)的对应行(Ti)的平均值;按照降序对向量(C)的每个值排序(140),从而使得由所述向量(C)的每个元表示的每个特征(Fi)按照降序排列;以及通过合并至少两个具有相似排位的标签的特征而基于经排列的特征来形成(150)新型的标签的集合。
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