[发明专利]用于检测致癌融合蛋白的邻近介导试验

摘要

本发明提供用于检测生物样品如全血或肿瘤组织中一种或多种致癌融合蛋白的活化状态和/或总量的基于抗体的阵列及其使用方法。在某些情况下，样品中存在的所述致癌融合蛋白的活化状态和/或总量可与一种或多种信号转导分子联合测量。本发明的组合物和方法具有酶联免疫吸附实验相关的特异性、信号放大相关的灵敏度、和微阵列相关的高通量多重性的优势。

主权项

1.测定样品中致癌融合蛋白的表达和/或活化水平的试剂的用途，用于制备试剂盒，所述试剂盒用在选择用于治疗癌症的合适抗癌药的方法中，所述方法包括：(a)给予抗癌药之后或用抗癌药孵育前分离癌细胞；(b)裂解所述分离细胞产生细胞提取物，其中所述分离细胞在裂解前未清洗以产生细胞提取物；(c)将细胞提取物与对第一全长蛋白的第一结构域特异的第一结合部分在适于将所述细胞提取物中存在的第一全长蛋白转变为含所述第一全长蛋白和所述第一结合部分的复合物的条件下接触，其中所述第一全长蛋白的第一结构域在对应的致癌融合蛋白中不存在，所述融合蛋白包含与第二不同全长蛋白的第一结构域融合的第一全长蛋白的第二不同结构域；(d)将步骤(c)中的复合物从细胞提取物中移除以形成不含所述第一全长蛋白的细胞提取物；(e)将步骤(d)中的细胞提取物与第二结合部分、第三结合部分、和第四结合部分在适于将所述细胞提取物中存在的致癌融合蛋白转变为含所述致癌融合蛋白和所述第二结合部分、第三结合部分、和第四结合部分的复合物的条件下接触，其中所述第二结合部分特异于第一全长蛋白的第二不同结构域，其中所述第二结合部分被限制在可寻址阵列的固体支持物，其中所述第三结合部分用辅助部分标记并对下述之一特异：(i)所述第二不同全长蛋白的第一结构域；(ii)所述第一全长蛋白的第二不同结构域；或(iii)所述第一全长蛋白的第二不同结构域和所述第二不同全长蛋白的第一结构域的融合位置，其中所述第四结合部分用信号放大对的第一元件标记，且对所述第二不同全长蛋白的第一结构域特异，和其中所述辅助部分生成传至信号放大对的第一元件并与之反应的氧化剂；(f)用信号放大对的第二元件孵育步骤(e)中的复合物，生成放大的信号；(g)检测信号放大对第一和第二元件产生的放大信号，由此测量所述细胞提取物中致癌融合蛋白的表达和/或活化水平；和(h)通过对比所述致癌融合蛋白测得的表达和/或活化水平与没有所述抗癌药时产生的参比水平和/或活化分布，测定所述抗癌药适合或是不适合用于治疗癌症。