[发明专利]基于网格的计算化学应用整合系统

摘要

本发明公开了一种基于网格的计算化学应用整合系统，包括分布式的化学资源部、网格中间件部、操作界面部；分布式的化学资源部分布在不同的网格结点，该部内设有安装了计算化学应用软件的计算资源和与化学领域相关的概念及方法的化学知识单元；采取对资源的共享和协作，并形成一个超过单机能力的计算平台；包括服务接口单元、作业调度单元以及知识库单元；将分子结构模型转换成计算机内部的数据结构的分子建模单元，采用显示分子的三维结构的分子可视化单元，协助用户将作业提交到网格，并监控、操作和下载的作业管理单元以及管理社区单元。用户能够通过这个系统进行分子建模、可视化、计算以及结果获取，享受便捷的一站式服务。

主权项

一种基于网格的计算化学应用整合系统，该整合系统是一个架构在网格中间件上的前后端处理三层结构，包括：分布式的化学资源部、网格中间件部、操作界面部；其特征在于：所述的分布式的化学资源部分布在不同的网格结点，该部内设有安装了计算化学应用软件的计算资源和与化学领域相关的概念及方法的化学知识单元；所述的网格中间件部屏蔽后端应用异构性，实现对资源的共享和协作，并形成一个超过单机能力的计算平台；包括服务接口单元、作业调度单元以及知识库单元；所述的操作界面部包括，将分子结构模型转换成计算机内部的数据结构的分子建模单元，采用显示分子的三维结构的分子可视化单元，协助用户将作业提交到网格，并监控、操作和下载的作业管理单元以及管理社区单元；所述的分子建模单元，设定原子是建模的最小单位，原子之间存在化学键，分子为链式结构，分子为链的集合，链由在空间中重叠的三维结构原子球构成；每一个原子球σ(pi，ri)有两部分，pi为原子球的中心位置，ri为原子半径，所有原子球重叠在一起，构成了集合AG；当两个原子之间存在化学键构成时，所有化学键构成了集合BG。原子球集合和化学键集合的并集构成了分子链C，而多个分子链构成了分子M；以下是分子建模的数学定义： AG = { σ ( p i , r i ) | ∀ 1 < i < r i , p i ∈ R G , r i ∈ R } BG = { b i ( f ln g , σ i , σ j ) | ∀ 1 < i < r i , σ i , σ j ∈ AG } C＝AG∪BG    M＝∪C所述的作业管理单元包括视图模块、模型模块以及控制器模块。