[发明专利]一种LTQ Orbitrap组合式质谱仪检测数据分析的方法

摘要

本发明对所研究的样品采用shot-gun法lable-free方式做差异蛋白筛选，所用仪器为LTQ Orbitrap组合式质谱仪。目的是能筛选到在样本间差异表达的蛋白，验证后选取相关蛋白做生物学功能研究，应用于疾病鉴别及诊断。其基本流程如下：步骤一：不同样品间差异蛋白的筛选；步骤二：差异蛋白的层次聚类分析；步骤三：Gene ontology分析；步骤四：KEGG pathway分析；步骤五：蛋白的network分析。

主权项

本发明通过对获得的LTQ‑MS原始数据进行数据预处理及均一化、差异蛋白的筛选、差异蛋白及样本的聚类分析、差异蛋白Gene ontology分析、Pathway enrichment分析以及Network分析。形成一套LTQ Orbitrap组合式质谱仪检测数据分析的方法，其基本流程如下：步骤一：不同样品间差异蛋白的筛选；步骤二：差异蛋白的层次聚类分析；步骤三：Gene ontology分析；步骤四：KEGG pathway分析。步骤五：蛋白的network分析。