[发明专利]抗体蛋白的分子改造辅助预测方法无效
| 申请号： | 201110191810.6 | 申请日： | 2011-07-08 |
| 公开（公告）号： | CN102222177A | 公开（公告）日： | 2011-10-19 |
| 发明（设计）人： | 曹志伟;吴迪;李亦学 | 申请（专利权）人： | 上海生物信息技术研究中心 |
| 主分类号： | G06F19/16 | 分类号： | G06F19/16 |
| 代理公司： | 上海智信专利代理有限公司 31002 | 代理人： | 王洁 |
| 地址： | 200235 上海*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种抗体蛋白的分子改造辅助预测方法，包括以下步骤：(1)扫描抗体与抗原相互作用界面的氨基酸残基；(2)对抗体与抗原相互作用界面上的氨基酸残基进行微环境判断；(3)确定候选改造位点，进行虚拟突变获得抗原与突变抗体复合物体系，计算结合自由能以及突变所造成的结合自由能改变；(4)根据步骤(3)的计算结果，按需求挑选可能对亲和力及特异性有较大影响的作为改造候选位点的氨基酸残基给出结果，从而指导实验。本发明设计巧妙独特，结合了抗体分子作用界面统计规律，能定性并定量的预测突变后抗体对抗原亲和力的改变，大大提高了预测准确度，适于大规模推广应用。 | ||
| 搜索关键词： | 抗体 蛋白 分子 改造 辅助 预测 方法 | ||
【主权项】：
一种抗体蛋白的分子改造辅助预测方法，其特征在于，所述的方法包括以下步骤：(1)扫描抗体与抗原相互作用界面的氨基酸残基；(2)对抗体与抗原相互作用界面上的氨基酸残基进行微环境判断；(3)确定候选改造位点，进行虚拟突变获得抗原与突变抗体复合物体系，计算结合自由能以及突变所造成的结合自由能改变；(4)根据步骤(3)的计算结果，按需求挑选可能对亲和力及特异性有较大影响的作为改造候选位点的氨基酸残基给出结果，从而指导实验。
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