[发明专利]单细胞分类和筛选方法及其装置有效
| 申请号： | 201110245356.8 | 申请日： | 2011-08-25 |
| 公开（公告）号： | CN102952854A | 公开（公告）日： | 2013-03-06 |
| 发明（设计）人： | 徐讯;鲍莉;何伟明;侯勇;陶晔 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因科技有限公司;深圳华大基因研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N5/00;C12M1/00 |
| 代理公司： | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人： | 曾晖 |
| 地址： | 518083 广东省深圳市盐田*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提出单细胞分类和筛选的方法，以及用于所述方法的装置。将样本测序得到的reads与参考基因组进行比对，并将比对结果进行数据过滤；根据过滤后的数据确定每个单细胞样本的一致基因型，并将所有单细胞样本的一致基因型保存为SNP数据集；从已保存的SNP数据集提取与参考基因组SNP数据集位置对应的位点的基因型文件；挑选细胞突变SNP位点，并根据细胞突变SNP位点的基因型文件，对细胞进行分类及功能基因筛选。本发明避免对细胞进行标记的操作，解决了传统的单细胞分类方法中某些细胞亚群无对应的特异性标记物而无法分类的问题；另一方面，全面完整地分析单细胞基因组的遗传变异信息，大大提高了细胞亚群分类的准确性。 | ||
| 搜索关键词： | 单细胞 分类 筛选 方法 及其 装置 | ||
【主权项】：
单细胞分类方法，包括以下步骤：将每个单细胞样本经测序得到的reads结果与参考基因组序列进行比对，并将比对结果进行数据过滤；根据过滤后的数据确定每个单细胞样本的一致基因型，并将所有单细胞样本的一致基因型保存为SNP数据集；从已保存的SNP数据集提取与参考基因组SNP数据集位置对应的位点的基因型文件；挑选细胞突变SNP位点，并根据细胞突变SNP位点的基因型文件，对细胞进行分类。
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