[发明专利]一种多样本间甲基化差异检测方法及装置有效
申请号: | 201110258798.6 | 申请日: | 2011-09-02 |
公开(公告)号: | CN102982253A | 公开(公告)日: | 2013-03-20 |
发明(设计)人: | 吴红龙;黄树嘉;王俊 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22 |
代理公司: | 深圳市威世博知识产权代理事务所(普通合伙) 44280 | 代理人: | 何青瓦;丁建春 |
地址: | 518083 广东省深圳市盐田*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明提供了一种多样本间甲基化差异的检测方法,该方法包括步骤:获得多组样本的基因组测序片段对应于参考基因组序列上的位置信息以及各个样本的甲基化数据;对在参考基因组序列上滑动的同一判断区间内的各组的甲基化数据进行分析,获取上述组基因组上存在甲基化差异的甲基化差异区域;对同一甲基化差异区域内的各组的甲基化数据进行分析,获取在甲基化差异区域内存在甲基化差异的具体组。本发明还提供了一种多样本间甲基化差异的检测装置。本发明的多样本间甲基化差异的检测方法及装置能查找并检测出多个样本基因组之间存在的甲基化差异性区域以及在该甲基化差异性区域存在甲基化差异的样本组。 | ||
搜索关键词: | 一种 多样 甲基化 差异 检测 方法 装置 | ||
【主权项】:
一种多样本间甲基化差异的检测方法,其特征在于,所述方法包括步骤:获得多组样本的基因组测序片段对应于参考基因组序列上的位置信息以及各个样本的甲基化数据;对在所述参考基因组序列上滑动的同一判断区间内的各组的所述甲基化数据进行分析,获取上述组基因组上存在甲基化差异的甲基化差异区域;对同一甲基化差异区域内的各组的所述甲基化数据进行分析,获取在所述甲基化差异区域内存在甲基化差异的具体组。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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