[发明专利]用于鉴别鼻咽癌中的预后型亚类的基因表达谱有效
申请号: | 201110276634.6 | 申请日: | 2006-09-22 |
公开(公告)号: | CN102346816A | 公开(公告)日: | 2012-02-08 |
发明(设计)人: | K-j·高;A·黄 | 申请(专利权)人: | 中国合成橡胶股份有限公司 |
主分类号: | G06F19/20 | 分类号: | G06F19/20;C12Q1/68 |
代理公司: | 永新专利商标代理有限公司 72002 | 代理人: | 林晓红 |
地址: | 中国台*** | 国省代码: | 中国台湾;71 |
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摘要: | mRNA转录物谱分析可用于阐明原发NPC远处转移的分子预测因子。所述预测结果与短的无转移和总体生存期高度相关。使用基于52个基因和基于12个基因的预测因子(predictor)进行预测。本发明总体上涉及评估和/或预测鼻咽癌的状态和结果的方法,包括测定与这种癌症相关的基因的表达水平,由此使得可以对这些癌症患者的结果进行个体化预测或评估。具体而言,本发明涉及用于鉴别鼻咽癌中的预后型亚类的基因表达谱。 | ||
搜索关键词: | 用于 鉴别 鼻咽癌 中的 预后 型亚类 基因 表达 | ||
【主权项】:
1.一种评估鼻咽癌患者发生远处转移的风险的方法,所述方法包括在来自所述患者的样品中评估表4列出的52个基因的表达谱,所述评估是使用通过应用于洛基分数(logit score)的组的k-最近邻分类方法而产生的预测规则来进行的,所述洛基分数的组是通过使用表1中相应的回归模型公式针对表4示出的9个基因簇中的每一个基因簇而产生的;使用以下预测规则评估表5中列出的12个基因的表达谱,
其中所述洛基分数(logit score)是使用表2所示回归模型公式基于所述12个基因的表达谱而产生;对比得自所述两个预测规则的远处转移风险值,由此当通过这两种方法确定的远处转移风险均为低或高时,则分别记录为低或高风险,当所述确定的风险不一致时,则记录为所述风险不确定。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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