[发明专利]病原体基因组序列数据库系统

摘要

本发明主要涉及到一个统一了几种不同类型的病原体序列信息的数据库系统，并在此基础上发展的一个对病原体进行遗传学、基因组学和系统发育研究的分析平台。所涉及到的病原体主要包括：细菌、真菌、病毒、原生动物、寄生虫。本发明有效地整合了各种来源的病原体基因组信息，能够实现数据分析与统计，原始数据及加工数据的查询和下载三者间的有机结合，并可实时地对各种病原体基因组数据进行收集、处理、分析和整合，从而建立了一个统一、稳定、高效的数据平台。

主权项

数据库的构建。本数据库是基于关系数据库模式而构建的。从总体上来看，在数据库中最终包含的信息有：谱系中各个等级的注释；按照宿主进行划分了的病毒基因组序列(EMBL格式)及其蛋白质产物与结构域的注释；按照病原体种类进行划分了的病原体基因组序列(EMBL格式)及其蛋白质产物与结构域的注释；各基因组序列的CDS、3’UTR、5’UTR、LTR、18s rRNA、5.8s rRNA和28s rRNA(对于细菌来说，后三类除外)序列信息(fasta格式)；细菌的16s rRNA、5s rRNA和23s rRNA序列信息；便于探针设计的序列信息(新fasta格式)。