[发明专利]一种基于概率统计模型的蛋白质二级质谱鉴定方法有效
| 申请号： | 201110358552.6 | 申请日： | 2011-11-11 |
| 公开（公告）号： | CN102495127A | 公开（公告）日： | 2012-06-13 |
| 发明（设计）人： | 肖传乐;马超;刘帅;陈晓舟;何庆瑜 | 申请（专利权）人： | 暨南大学 |
| 主分类号： | G01N27/62 | 分类号： | G01N27/62 |
| 代理公司： | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人： | 杨晓松;裘晖 |
| 地址： | 510632 广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于概率统计模型的蛋白质二级质谱鉴定方法，该方法首先虚拟酶解蛋白质数据库序列，并根据肽段的质量数对酶解后的肽段建立肽段数据库和肽段数据库索引；然后根据待分析实验图谱中母离子的核质比在肽段数据库中找出符合要求的候选肽段，并对找到的所有候选肽段产生符合要求的理论图谱；然后对待分析实验图谱进行去同位素和去噪处理；对处理后的待分析实验图谱和每张候选肽段的理论图谱进行匹配打分，选择分值最高的候选肽段作为此实验图谱的鉴定结果；最后针对所有实验图谱鉴定结果进行整体假阳性控制。该方法鉴定有效质谱的数量和蛋白质肽段数量均高于目前现有算法，且可动态选峰，运行速度快。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 概率 统计 模型 蛋白质 二级 鉴定 方法 | ||
【主权项】：
一种基于概率统计模型的蛋白质二级质谱鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)虚拟酶解蛋白质数据库序列，并根据肽段的质量数对酶解后的肽段建立肽段数据库和肽段数据库索引；(2)根据待分析实验图谱中母离子的核质比在步骤(1)所述的肽段数据库中找出符合要求的候选肽段，并对找到的所有候选肽段产生符合要求的理论图谱；(3)对待分析实验图谱进行去同位素和去噪处理；(4)将步骤(3)得到的待分析实验图谱和步骤(2)中得到的每张候选肽段的理论图谱进行匹配打分，选择分值最高的候选肽段作为此实验图谱的鉴定结果；(5)针对所有实验图谱鉴定结果进行整体假阳性控制。
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