[发明专利]线性时间后缀数组构造方法

摘要

本发明提供了一种线性时间后缀数组构造方法，包括：1)从右向左扫描字符串S，比较当前两个相邻字符S[i]和S[i+1]，得出每个字符和后缀的类型，记录于数组t[i]；2)从左到右扫描t[i]，找出所有LMS字符位置，获取所有LMS子串首字母指针，记录于数组P1；3)通过LMS子串指针数组P1、数组B和SA对S中所有的LMS子串进行排序，结果保存SA1中；4)重新命名字符串S中各个LMS子串，形成字符串T1，然后对T1各字符根据其L和S类型进行重命名，形成的新字符串保存到S1；5)判断S1每个字符是否唯一，如果是，则直接排序S1的各后缀来计算S1的后缀数组到SA1中，否则以S1和SA1作为输入参数返回1)；6)根据保存于SA1中的S1的后缀数组归纳计算S的后缀数组到SA中；7)返回。

主权项

一种线性时间后缀数组构造方法，其特征在于，它包括：1)标记字符串中每个字符和后缀的类型，从右向左扫描一遍字符串S，按照后缀类型的定义比较当前扫描的两个相邻的字符S[i]和S[i+1]，得出每个字符S[i]和后缀suf(S，i)的类型，记录于数组t[i]；2)从左到右扫描一遍t[i]，找出其中所有LMS字符出现的位置，从而获取所有LMS子串的首字母指针，用数组P1来记录每个LMS子串的指针；3)通过LMS子串指针数组P1、数组B和SA来对S中所有的LMS子串进行排序，结果保存在SA1中；4)根据步骤3)排序的结果重新命名字符串S中的各个LMS子串，形成字符串T1，然后对T1的字符根据其L和S类型进行重命名，形成的新字符串保存到S1；5)判断S1的每个字符是否唯一，如果是，则直接排序S1的各后缀来计算S1的后缀数组到SA1中，否则以S1和SA1作为输入参数，返回到步骤1)；6)根据步骤5)中获得的保存于SA1中的S1的后缀数组归纳计算S的后缀数组到SA中；7)返回。