[发明专利]基于宏基因组16S高可变区V3的分类方法和装置

摘要

本发明公开一种基于宏基因组16S高可变区V3的分类方法和装置。该方法包括：提取微生物样品中的DNA；对宏基因组16S rDNA的高可变区V3进行扩增，对扩增产物进行Solexa建库，同时在建库过程中通过加上带有标签序列的接头，对每个样品进行标记；将带有标签序列的不同样品进行混合，混合后使用Solexa测序工具进行测序，得到按照标签区分的原始的测序序列reads；利用reads的重叠关系组装得到高可变区V3的全长序列unique reads；对unique reads进行分类分析，以实现对微生物群体的分类。本发明的方法和装置，对微生物群体的分类准确，且大大降低了测序成本。

主权项

一种对宏基因组16S高可变区V3进行测序聚类分析的方法，其特征在于，该方法包括：提取微生物样品中的脱氧核糖核酸(DNA)；对提取DNA的宏基因组16S核糖体脱氧核糖核酸(rDNA)的高可变区V3进行扩增，得到作为扩增产物的DNA片段；对DNA片段进行PCR‑Free Solexa建库，建库过程中在DNA片段上加上标签序列以对每个样品进行标记；将各个样品的带有标签序列的DNA片段进行混合，使用Solexa测序工具对混合后的DNA片段进行测序，得到按照标签区分的测序序列(reads)；利用测序序列的重叠关系组装得到高可变区V3的全长序列(unique reads)；对全长序列进行分类分析，以实现对微生物群体的分类。