[发明专利]构建细胞代谢产物网络的新算法无效
申请号: | 201110458950.5 | 申请日: | 2011-12-29 |
公开(公告)号: | CN103186718A | 公开(公告)日: | 2013-07-03 |
发明(设计)人: | 刘极龙 | 申请(专利权)人: | 上海聚类生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/26 | 分类号: | G06F19/26 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200333 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 构建细胞代谢产物网络的新算法,本发明根据已知的代谢通路,将其整合生成一个完整的代谢网络。可以全局上观察代谢物之间的关系,对于分析代谢通路之间的互作具有指导意义。本发明主要包括如下流程:步骤1:获得代谢组学实验数据;步骤2:根据筛选标准,选择差异表达的代谢物;步骤3:对代谢物进行代谢通路分析;步骤4:分离每个代谢通路中代谢物之间的关系;步骤5:构建代谢网络;步骤6:使用cytoscape软件生成最终的网络结果。 | ||
搜索关键词: | 构建 细胞 代谢 产物 网络 算法 | ||
【主权项】:
本发明根据已知的代谢通路,将其整合生成一个完整的代谢网络。可以全局上观察代谢物之间的关系,对于分析代谢通路之间的互作具有指导意义,本发明主要包括如下流程:步骤一:获得代谢组学实验数据;步骤二:根据筛选标准,选择差异表达的代谢物;步骤三:对代谢物进行代谢通路分析;步骤四:分离每个代谢通路中代谢物之间的关系;步骤五:构建代谢网络;步骤六:使用cytoscape软件(www.cytoscape.org)生成最终的网络结果。
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